CSH_0033_Complete Single nucleotide polymorphisms
            1 ATGGAAGAAG  AAAATGATTT  TCTGAAACTT  TCTGTTGAAG  ATAGATGTCA  ACATAAACTG   60
            61 TGGAAAGCAA  GATTGAGTGG  TTATGAAGAT  GCTGCCAAGT  TATTTCTTCA  GCAGGATGAT   120
            121 GAGAAAAGCC  CAGAATTTAT  GAAATATTTA  GGACTGTTAA  AAAAATTTGT  AATTGATAGC   180
            181 AATGCTGTTG  CCCAAGAAAA  AGGTTTATCA  GCTGTCTTAG  CTTTTGTGGA  AAATGCAGCA   240
            241 TGTGCTCCAA  GAACTGTTAA  TGATGTTATG  AGTGGACTTG  TAAGTAAATG  CTTTTCTTCA   300
            301 CCTCGAGCAA  AAACACGAGA  GCTGGCTTTA  GAAATAGCTC  TAATGTATAT  TGAGATTGAG   360
            361 AAACAAGATG  TAGTTTTAGA  AGAATTGATC  AAAGGTCTTG  AGAGCAAATC  ACCTAAGGTT   420
            421 GTAACTGCAT  GTATCATTGC  TTTACGTGAA  TCACTAAACT  TATTTGGTTC  CAAAGTCATA   480
            481 GCCATTAAAC  CCCTTGTGAA  AGTTTTACCT  AAAATGTTAG  AGGATAGGGA  TAAAAGTGTT   540
            541 AGAGAAGAAT  CAAAAATGTT  ATGTGTAGAA  ATATATCGTT  GGGTAGGAGA  AGCTATCAAG   600
            601 CCTCAGCTGC  AAACTTTAAA  ACCTGTAACT  CTGACAGAAT  TAGAAGGAGA  GTTCCAGAAA   660
            661 ACTGTTGGAG  AAAGAGTTAC  AGCTACTCGG  TATTTAAAAT  CTCAGCAAGA  AAAGATTGCT   720
            721 AAAGCTAAAG  AAGAAGGTGG  TGATACAGTT  GAAGCAGAGG  ATGATGCTGT  AGTTACCGGA   780
            781 CCTCCACAAG  TTGACCCTTA  TGATTTAATG  ACTGCTGTAG  ATGTACTTTC  AAAATTGCCA   840
            841 AAAAACTTCT  ATGAGCAGTG  TGAAGCCAAA  AAGTGGCAAG  AACGTAAAGA  AGTATTAGAA   900
            901 ATTTTGCTGC  AGATGACAAC  CAACGTGAAA  TTAGAAGCAG  GTGATTATGG  TGATCTTGTT   960
            961 AGAGTATTAA  AAAAATTTAT  TGCCAAAGAT  TCTAATGTTC  TGGTTGTGGC  TCTAGCAACT   1020
            1021 AAATGTTTAA  CTAATCTTAT  TGTAGGTTTG  CGTAAAAAAT  TTCAGCCATA  TGTCTCTGCT   1080
            1081 TGCATTCCAG  CTATATTTGA  AAAATTTAAA  GAAAAGAAAC  AAAATGTTGT  AACTGCTCTT   1140
            1141 CGAGAAGCTA  TTGATGCGCT  GTATAGTATT  AGCTCTTTTG  AGAATATGCT  TGAAGATATT   1200
            1201 CAAACAGCAT  TAGATAATAA  GAACCCACAA  GTGAAGGCAG  AAACCTGTGC  TTTTTTAACA   1260
            1261 CGTTGCTTTT  GCTCATGCTC  ATCATCACAA  TTAAATAAAA  AATTACTCAA  GGCCTTTACA   1320
            1321 ATTTCTTTAT  TGAAGACTTT  AAATGATACA  GATTCTGTTG  TCAGAGAAAA  TTCAGCAGAA   1380
            1381 GCATTAGGTA  CTGCATTTAA  AGTTGTTGGT  GAAAGAATAA  TGTCACCATT  TCTACAAGAG   1440
            1441 GTAGATGCAA  TTAAAATGGT  AAAAATAAAG  GATTTTTGTG  ATAAAGCTGT  TGTAACTGCA   1500
            1501 AAGCCACAAC  AAGCTCAAGC  TGCTGAGAAA  AAGCCAACTT  CTGCTCCAGC  AAAATCTATT   1560
            1561 GTAACAAAAC  CAGAGGAAAA  TGTGCCAAAA  TCAGTAATGG  GTGGAGGTAA  AAAACAAGCT   1620
            1621 TCAGCAGGTA  CAGTCAAACC  TAAATCAGCT  CCTGCTCAGT  CAAAAATAGT  GAAATCTGCT   1680
            1681 GCAGTTAAGA  AAGGTGGGGG  TGAGCCTGCT  GAACCTGAAT  TCAAAGAACA  AGAACTTACG   1740
            1741 GATGAAGATG  TTATAACACA  AGCATCGGAA  ATTTTTACAG  ATGATGTAGT  TACTGGCTTG   1800
            1801 TGTAGTTCTA  ATTGGAAAGA  TCGATTGGCA  GCTGTTGAAA  AGTTTTTTGA  AGTTGTCCAG   1860
            1861 CAAATGGAGA  AAGAAAATAT  ACCAGCTCAA  GCACTAATAA  AATTATTGGC  GAAAAAACCT   1920
            1921 GGTTTTAAAG  AAAATAATTT  TCAAATATTA  AAATCGAGAT  TTGAAATTCT  TTCTTATATT   1980
            1981 GCTGACAATG  GTCAAATATC  TCATATAAGT  GTTGCAAGTT  GCTTGTCAGA  TGTAGTTGAT   2040
            2041 AAAATTGGTG  ATGCAAAGAA  TGGTGCATTT  GCTGGTTCTG  CACTTAGTTC  TTTAGCTGAA   2100
            2101 GCTACAAGTT  TAGAATATGT  TAGTCTTGAA  GTTTTGAATC  TGGCATTTAA  TCAGAGAAAT   2160
            2161 CCTAGAAATC  AATCAGAAGC  GATATTATGG  GTGTCAAATG  CAATAAAACA  CTTTGGCCTA   2220
            2221 AAAGTTAATG  TCAAAGATGT  GATAGACTAT  GCTAAGAAAG  CATTTTCATC  AACGAATCCA   2280
            2281 GCTGTGAGGA  ATTCTGCTTT  ATCACTTGTG  GGGACAATGT  ATATGTATGT  AGGAAGAAAT   2340
            2341 TTGCGTTCAT  TTTTTGAAGA  TGAGAAACCA  GCATTATTGC  AACAAATTGA  TTCTGAATTT   2400
            2401 GAAAAAATGA  AAGATGTTAA  ACCTCCTTTA  CCAGAAAGAG  GAAAAGGAAG  CAAACAAGCT   2460
            2461 GGTTGTTCTG  GAGATACGAT  TGAAAGTTCC  AAAGGAGGTG  CACAACAAGT  AAATCTTGCA   2520
            2521 GACTTAATGC  CCAGAGTTGA  TATTAGCAAC  CAAATAACTC  AGCAATTACT  GTCAGATCTA   2580
            2581 TCTGATAAAG  ACTGGCACTT  ACGCAGTGAT  GCATTGCAGA  AAATATCTGG  AATAATTAGT   2640
            2641 GATGCAAAAT  TCATTACTCC  TAACTTAGGT  GATTTGCCTA  GTGCTTTAAA  ACCTAGACTG   2700
            2701 GCTGATACTA  ATAAAAAGTT  GGCTGTACAA  GCATTAGGTA  TTTGCCAGAT  GTTAGGAACA   2760
            2761 TCATTAGGCT  CCCACTGTTC  CAAACAAATA  AGAAATTTTG  CTCCTGGAAT  ACTTACTTGT   2820
            2821 TTAGGTGATA  ATAAGGCTCA  TGTAAGAGCT  GCAGCATTAC  AGTGCTTAAA  TTCTTGGATT   2880
            2881 GATAACTGCT  CTTTAACTTG  TTTATTTGAA  GGAGAAATGA  TTTTTGATGT  GCTTAAATCA   2940
            2941 GATAATCCAT  TTTTAAGGAT  TGAACTATTT  TCATGGTTAA  CTGAAAAACT  GCCTACTGTA   3000
            3001 ACATCTTTAC  CTGCATCTGA  ATTAAATCTT  TGTATTCCAA  TTCTGTTAGG  ATGCTTAGAA   3060
            3061 GATCGTAATG  CTGATGTGAG  AAAAAAAGCA  TCAGAATGTC  TTCTTCCTTT  TATGATTCAT   3120
            3121 GTAGGTTATG  AATCTATGGC  TAGAGCTGCA  TCCAAATTGA  AACCAGCATC  AAAAAACACT   3180
            3181 GTTATGGCAC  AGCTGGAGAA  AGTTCGCCCG  AATCTACCTG  AAAAGCCTAG  CAATAAACCA   3240
            3241 AAACCAACTA  GAAATACCAT  CCCTGCACCA  AGTGAAAGGT  CCTCTCCTCC  ACAGGTTACA   3300
            3301 GGAGCTGAAG  ATGGTGTGAA  AGGAAAATTA  AATCGCAGTT  CATCTAAATC  TAAACTTGCA   3360
            3361 TTAAAAGCTC  CTTCAGCCTC  TTCCAAAGGG  AAGAAAGAGG  AAGAAATAGA  TACATCACCC   3420
            3421 TCCCTTGTCA  TTAATAATAT  GAAAGATCAG  AGGCTACTAG  ATGAAAAAGC  TCTGAAAGTT   3480
            3481 TTGAGATGGA  ACTTTACAAA  CCCCAGGGAA  GAATTTTATG  TTCAGTTAAA  AGATCAAATG   3540
            3541 ACCTCAGGAA  ACTGGAGTAA  AACATTAATT  TCTCATTGCT  TTCATAATGA  CTTTAAGTTC   3600
            3601 CACATTAAAG  CAATTGATTT  ACTCATAGAA  TCATTGGAAG  GTGCTGTGGA  ACCATCAGCT   3660
            3661 GCAAATCTAG  ATTTAATACT  GAAATGGTTT  GCTTTACGAT  TCTTTGACAC  TAATCCAAGT   3720
            3721 GTTTTGATTA  AAAGCTTGGA  GTATTTACAG  GCTTTATTTC  AATCACTTTC  ATGCATCAAT   3780
            3781 TATCGTTTAT  TAGAGCCTGA  AGCTGCATCT  TTTGTTCCTT  ACTTAATTCT  GAAAATGGGT   3840
            3841 GATTCTAAAG  ATCCAGTTCG  TAAAGGTGTG  AGGGAAATTC  TTAAAACTAT  TGGTAAAATT   3900
            3901 TATCCAAGTA  GCAAAATGTT  TTCATATATC  ATGCAGGGTT  TAAGTTCCAA  GAATGCTAGA   3960
            3961 CAACGAGCTG  AATGCCTTGA  AGAACTTGGT  TCTATGATTG  AGATATTTGG  TCTGAATGTT   4020
            4021 TGCCAACCCT  CTCCAGCTGC  TGCTTTGAAA  GAGATTGCCC  GCCAGATATC  TGACCGTGAT   4080
            4081 AATAGTGTCA  GAAACGCATC  ACTTAACTGT  TTCGTGCAAG  CCTATTTTAT  TGAAGGTGAG   4140
            4141 AAAGTGTATA  AATATGTTGG  GCAACTATCT  GATAAAGATA  TGAGTTTACT  TGAAGAAAGA   4200
            4201 ATAAAACGGA  GTGCCAAGAC  AAGAATGGTG  AAGCCTTCAG  AAAGTAAACC  AGCTGTTACT   4260
            4261 GCAGTATCTA  GCATTCCTAC  AAATTTAAAT  GCAGCTGTTG  CAGTAGAAGA  ACCTCAGAGA   4320
            4321 TTATCTCAAG  TAGCTACGTC  ACGAAATCAT  CCTTCTGGTC  CCTTGAGATT  AGAGACTGAT   4380
            4381 GACATTGAGC  AGATGTTCAG  ACACAAACAG  TCTGAATTTG  AAGTGCCTGG  ATTGGTTAAA   4440
            4441 GTCAATGCAG  ATGATATACT  TAACCTACCT  GACATTCAAC  TGCCACCAAC  TCGACTAAGA   4500
            4501 CCTCCAGCAT  CATCATTAAA  ACTTCTGAAT  AATTCAGCTG  AAGCCAATAC  TGCTGTAAAT   4560
            4561 CTTGTTATGG  CTCAGTTAGC  TGCCCAAGAA  ATTCCTGTTG  TAGTTGAAGC  ATTTGCTCAA   4620
            4621 GTTGAAGAGG  TGCTTAAACA  GAGTGAGCAA  GCAATTGCTG  TGTTAGGGCC  TCGTGTAGAT   4680
            4681 CAGTTACTTG  TAATGGGGGC  TATGCAGTAT  CGATATGCAC  ATACTAAACA  TATGGCAGAT   4740
            4741 GAAAATATAT  GTAAAGCCGA  TGTAATACGG  TTGTACAGAT  GTGTAACAGT  AGCATTAGTA   4800
            4801 ACATTATTTG  ATAATCCTGT  TCTTGCAAAA  AAAGCTAGTA  GAGATGTATT  GAGAGATTTA   4860
            4861 ATACCTCATC  TTCTTACTGT  TATGCTAGAT  AATAGGCTGG  ATGACTTGCA  AGAGGGTGCA   4920
            4921 CAAGTCGTGA  AAGTTATCAA  TGTTTTAATT  ATGAGAGTCT  TACAAAAATC  AAATCCAACC   4980
            4981 CATGTTTTAA  GTGCACTAAT  TAAACTTCTG  CATGATTGTG  TTGGAAGTGT  CAATGTTTCA   5040
            5041 GATCGTTTTA  CAGATTTAGT  TATGAAATGT  CTGTGGAAAA  ACATTCGTCT  TATCCGTCAG   5100
            5101 GTCATAAATG  AGTTAAATAT  TGATCGAATT  TTACTTGATG  TACATGTATT  TTTGAAAACA   5160
            5161 TTTCCTTCAT  CATCATGGAA  AGAAAGGAAA  GATGACACAC  CTATCCGTAC  TATTAAAACT   5220
            5221 ATTTTGTATC  ATTTTGTAGA  AATCAAAGAT  GAAGACATAA  TGAAACACTT  GTCCTTAATA   5280
            5281 TCAGATAGGC  AAGAATCTGA  CTTAGTAAGT  TATCTTCACA  AGTTATTAGC  TAAAAGAAAA   5340
            5341 GGTGACAATC  GAAAATCACT  CAATAAGAAC  ACAGTTCCTG  ATGATAATCG  TCATAAAAGG   5400
            5401 AGCAGGTCAT  CTCCTTTGAA  GCTGTCAAAA  TCAACTCATG  AAGCTTTGAC  AGAAATTTTC   5460
            5461 AAAAAGATTG  GGTCAAAAGA  ACAAACAAAA  GAAGGACTTT  CAGAATTATA  TGATTTTACT   5520
            5521 CAAAAGCATC  CTGAAGCTGA  TATCGAACCA  TATCTCAAAA  ATTCTTCTGA  CTTTTTCCGC   5580
            5581 AATTACATTC  GCCAAGGCAT  CAAAGATCTT  GAAAGGAAAA  GGAGCACTGG  CACAGATTCT   5640
            5641 CCAGTTCCCA  AGTCCAGAAA  ATCTGAAGAA  TGGAATTCTA  ATTTATCCGG  GAATGATTCA   5700
            5701 CTCTTTAAAG  AAAAAACTGG  TTCACTCTCA  TGGCAGGATA  AATTTCCCCC  TCTACCTCCA   5760
            5761 CCTACCATAG  ATACTACTCC  TATGGACTTA  GTTGAGTGGC  TTAAAAGTGT  TGTTGCCCGT   5820
            5821 TTGGGAATGG  ATACATCAAA  ATATGATGAT  CCAGCCTTCT  TGGAAAAAAT  CATGGGAAGT   5880
            5881 GATAGTGAAG  GCAATGTAGA  TGAAGACATT  GCACAAATAT  TTGCAGATAT  TGAGAGATAC   5940
            5941 AAAAAAATCA  TCCAAGACTT  AAAAAATGCT  GCA       5973
Single Nucleotide Polymorphisms
154C= 0.82A= 0.16G= 0.02 
404G= 0.58A= 0.42  
483C= 0.63T= 0.37  
528G= 0.83A= 0.17  
607C= 0.87T= 0.13  
789A= 0.58G= 0.42  
1857C= 0.57T= 0.43  
2428T= 0.64C= 0.36  
2480T= 0.51C= 0.49  
2949A= 0.52G= 0.48  
3159G= 0.55A= 0.45  
3212A= 0.67G= 0.33  
4248A= 0.57G= 0.43  
4465C= 0.56T= 0.44  
4479A= 0.60G= 0.40  
4791A= 0.54G= 0.46  
5100G= 0.51A= 0.49  
5142A= 0.58G= 0.42  
5409A= 0.59G= 0.41  
5556C= 0.63A= 0.37