CSH_0085_Complete Single nucleotide polymorphisms
            1 ATGAATTTAA  AGATGTCTTT  CCTATCCGTC  TTTCGTCATT  CCATCATTTG  TGTTTTCGTC   60
            61 TGCTTGCCTG  CACTGCATTT  CGTAACGAGC  CAGAAACACA  CCAAGATTCG  GAACCTCCTA   120
            121 AGTTACACAA  ATCGCATCCA  TCCATCCTCT  ATGCAACGAG  TGGTTGTCCG  AAATTCCACC   180
            181 AGTGATGTGT  ACGTCAGTGC  TCGCAACTCA  CTGTATCACT  TTAACTCTGA  CTTACGCGTG   240
            241 AAACGAGTGA  TCTCAACTGG  GCCCGAACTG  GACAATCCCA  GATGTCTGCA  TCCCAGCGTC   300
            301 CCCTGCTCAC  AAAACAGGAC  AATTACAGAC  AATGACAACA  AAGTGTTGGA  AATATTCCAA   360
            361 GCGTCTAAAC  CTCCCCTCTT  GTTGACTTGT  GGCACATTGT  ACCAAGGTCT  CTGCCAAGTG   420
            421 CAATCTCTGA  ACGATATTAG  CAGACGGAAG  TGGGTCCAAC  CGTTTAACCA  AACGGTTGGA   480
            481 TTTACGTCTG  GAAGAGGCTC  TACGGTGGCC  TTCTTTGCCA  AAGGTTACAA  CAATCAGCTG   540
            541 TCTCTGTATT  CAGCTTCAGC  GTATGACAAC  CGTCCTTTGC  AATACAGTCC  ACCTTCTGTG   600
            601 TCTAGCAAAA  TTCTGTTGCT  GCAATCTGAA  AGCTTCAATT  TCAAATATTC  GGACAAGACA   660
            661 GACACGTCTT  TCACTGGTGT  AAATTTTAAA  ATGAAAGAGA  ACTTTGGGGT  TCAGTATATC   720
            721 ACAGGCTTTG  GCCACGATGG  ATTTGCCTAC  TTCTTAACAA  CTCAGAAAGT  GTCACTAGAG   780
            781 TCCGAATTCT  TCGAAACGCG  GCTGGCACGG  GTGTGTGCGA  ACGATTCTGC  CTTTTTCTCC   840
            841 TATACAGAAG  TACCCGTTAA  GTGCAATTAC  GGCCTGGAAG  TGTACAATTT  GGCAACAGCT   900
            901 GCTCACATGG  GGATTGCAAG  CGGGCAGCTG  AAGCGGATTC  TGAAGCTGGA  CAAGGTAATC   960
            961 GATGTGTTGT  ACGTGTCTTT  CGTGAGGACC  ATACCTGATC  ACGGGAGACA  CGCGGACAGG   1020
            1021 TCAAAAGGTT  CTGTGATATG  TTCATTCCCA  ATGTCGACTG  TGATTGCCTC  TTTTACTAAT   1080
            1081 GCCACCAAGG  ACTGCTTTAA  AGCTCAGCCC  AGGACTTCGT  TGCTTAAGCA  CGTGACTGGC   1140
            1141 GTGTCTTTAT  CGTGTGTAAA  AAAGGATGAT  GTGGAAATAC  GGGACGACTT  CTGCGGCTCG   1200
            1201 GCGTTTAACC  ACTACATAGC  CGGTTCTGAG  TCAATACCTG  GAGGATTTCG  GACGCATCTT   1260
            1261 GACGTACACA  TCACCTCTCT  AGCCACTACA  CTGCAGAAAA  ACAAACCCAT  TGCCGTAGTG   1320
            1321 GGAACCGATT  CGGGAGATAT  TCTTAAGGTC  GATTTGGACA  AAAGAGATAG  GGTCATCTTT   1380
            1381 TACTCAAAGA  ATATTGCTGA  TGAAAATGAT  GAAGATAAAA  GAATTCAGAG  TTCTAATGCT   1440
            1441 TTCGATCCTC  GTCGTGAAAA  TATATACTTT  CTTGTCGGAA  AAAAGGTGGT  GAAGTTTCCG   1500
            1501 ATTAGCTCTT  GCTCCCTTTA  CACTGACTGT  CATTCCTGTC  TCACCATGGA  AGATCCTCTC   1560
            1561 AAATGTGGAT  GGTGTGGAAA  CCACTGTGCT  CATTTAGACG  AATGCGAAAC  ACCCGATAAC   1620
            1621 TTTTCTACAA  GTGTGTGTTC  TCCTCAAATC  TTTGATGTCA  GTCCTTTGCG  AGGTCCTACA   1680
            1681 GAAGGTGGTA  CTCTCCTAAC  AGTTATCGGT  GATAACTTTG  GCTCATCACA  GGGTGGAGAG   1740
            1741 CATCATTCCA  CGTTGTCTGT  GACAGTGGCT  GGTATTCCGT  GCGAGCTGCA  TACATGGGAG   1800
            1801 AAAGAGAAGA  TCCAATGCAA  GACAACGGCT  GTCAAGGAAT  TCACTCTCTC  TGGAGTCATA   1860
            1861 GAAATCACAG  TTTCCGACAT  TTCTTGGATG  AGTGGAAGTT  ACGACATGAA  AGGAAAAGTG   1920
            1921 AGCAGTCAAG  AGAGCTTTAC  TTATGCTACA  CCTATTCTTT  ATGGAATTTA  TCCTGGCAAA   1980
            1981 GGTCCTGTGT  CTGGCGGAAC  AAATATTACA  CTATATGGAA  ACAGATTAAA  CGTGGGTTAT   2040
            2041 TCTAGAACGA  TTAAAATTGC  TGGCGTGCCT  TGCAGGAAAA  TCAGTATTGG  AGAAGACTCT   2100
            2101 GCCTGGTGTT  TCTCTGATGA  ATTACCCAAA  GAATCTTCTA  AGGGACTTGA  TAACGACTCG   2160
            2161 TTCGTTGGTC  CAGTAGAACT  TCACATCGAT  GATGCTGTAA  TCGAAATCGA  AAATAAAATC   2220
            2221 GCTGCTGGAT  TGCAATTCGA  GCATCCAATA  TCGAAAAATT  TCGTATACTT  ACCAGATCCG   2280
            2281 GAGATATTCA  GTATACATCC  TCAAACGACG  ACAATGAGTG  GGACTAAGAA  CCTGACCATA   2340
            2341 ACAGGAAGAT  ATTTGAACAG  TGTAGAGACT  GCCAGGATGA  TTGTGAACGT  GGCTTCATCC   2400
            2401 GTTACTAGAG  AATCTCTTCA  AGTTATATCA  GATCCATGCT  GGCTGAACGA  CACTTCGGAC   2460
            2461 GGCAGCACGA  TGGTATGTCC  AACGCCTCCT  CTTCAGCAGT  TGACCTACCA  CGCCCCAACA   2520
            2521 GCTAGAGCAC  CCCTCGTGAC  TAACGTGGGG  TTTCTGATGG  ACGGGGTGCA  GAAGCTTAAG   2580
            2581 CAACTTCCGA  TCCACGAGAT  GAAGCTTTCG  CAACTTCTTT  ACTACCCAGA  TCCAGAGTTT   2640
            2641 GAAAAAGGAG  GAATAATGAA  AGTGTCCTAC  GATCAGAATA  TTTTGGAAAT  CAAGGGTAAA   2700
            2701 TATATAGATT  TAGCTCTTGA  AAAATCGGAT  GTAAAGGTTT  TACTTGACAA  TAACACCAGC   2760
            2761 TGTACTGTAA  CATCTGTAAA  ATCAGAATCC  ATTTCCTGTG  CTTTACCACC  CTTGGAGTCT   2820
            2821 TTTAGTGTGC  TGAACACGTC  TGTACACTCT  GTAGTGGTGT  CCATTGGACC  TTTGACATTT   2880
            2881 ACCATTGGAG  GAGTGGAATT  CATTGACGAT  GAATCAATGA  CTAAGAGTCC  TACCACTTGG   2940
            2941 ATAGTAGTTC  TTCTGATTTT  GGCTTCCATA  CTTATCGGGT  GTGTAGGTAT  AGTATATAAA   3000
            3001 TTCTGCATAA  AGAAAAAGAA  GAAATACCCC  GATTATGCTG  TGCACTTCAC  TTGGAATGGA   3060
            3061 AACCAGAATA  CTTGCGCAGC  TGTCACCAGA  CAGCCTAGCA  ATTGCAATGA  CTATCAAGAC   3120
            3121 TTGCCTGGCA  GACGCATGCT  TCGCCAGAAC  TCAGTCGCAG  CAGCTGTTCC  AGAGGAATCC   3180
            3181 TGTCAACGTG  CTGCTTCTAT  TTCGTCGGTA  GATGAAGAAA  CTATGCTTCT  CTTACAATCA   3240
            3241 CAAAATATTC  TAGTGCCTAG  GAATTATCTG  TCTCTAGGCG  AAGTCATCGG  AGAAGGTCAT   3300
            3301 TTCGGTTGTG  TCTATAAGGG  TGAACTTCAG  CTTCCTAACA  AGGATAGTAA  ATTAGAAGTT   3360
            3361 GCTGTGAAAA  CTTTGCATAA  TAGTTGGTCT  CCTATCGAGC  AAGACAGTGA  AGCATTCTTG   3420
            3421 CAGGAGGGTC  TGATGATGAA  AGATTTCCAC  CATCACAACG  TTCTTACTTT  AATCGGAGTC   3480
            3481 TGTTTTGATG  GAGATAGTTC  TCCCATGGTA  ATCATACCAT  TCATGAAACA  TGGAGATTTG   3540
            3541 TTGTCCTTCA  TACGTAATGA  GAATAATAAT  CCTACTATAA  AGGATTTGCT  TACATTTGGC   3600
            3601 GTACAAATTG  CTGCTGGTAT  GAAGTACTTA  GCCGAAATAA  AATTCGTCCA  TCGTGATTTA   3660
            3661 GCTGCAAGAA  ACTGTATGTT  GGATGATGAT  AAAACGGTGA  AAGTTGCGGA  TTTTGGATTA   3720
            3721 TCTCGGGATA  TATACGAGAG  GGATTACTAC  AGCAGCGACA  ATAAGAAGAC  TAAACTGCCC   3780
            3781 ATCAAGTGGA  TGGCTCCAGA  GAGTATAGAA  AAAGGAACTT  ACACAACGAA  GTCTGATGTG   3840
            3841 TGGTCTTACG  GAGTAGTGTT  ATGGGAGCTG  ATGACTCGAG  GCGTTGCACC  GTATCCAGGT   3900
            3901 GTCGATAACT  GGGATATACT  CCAGTACATA  AAACTGGGAA  GGAGAATGCC  GCAGCCATCG   3960
            3961 TACTGTCCAG  ATCTTTTGTA  CGAAATTATG  CAAATTTGCT  GGGATGAGGA  ACCGAAAAGA   4020
            4021 CGGCCTACGT  TTGCCGAACT  AGAACAGAAA  GTACAAGGAG  TCATTACGAA  ACTTCAGCGG   4080
            4081 AAGAGCAGGC  AAAGAACGGT  TGGGCTGAAT  GTGACGTACG  TCAATTACCC  AGCAACGTTA   4140
            4141 CACAAAGAGG  AAGCAGCGGA  AGCTACG         4167
Single Nucleotide Polymorphisms
1485G= 0.78A= 0.22  
1575T= 0.55C= 0.45  
2175A= 0.50G= 0.50  
2296C= 0.89T= 0.11  
2619T= 0.79C= 0.21  
2646A= 0.79G= 0.21  
3045C= 0.79T= 0.21