CSH_0095_Complete Single nucleotide polymorphisms
            1 ATGGAGAAGC  AACCTCAGGC  GGATCCTTCC  CTGAAGACGC  CTGTGTCCAA  ATCGCCGCTT   60
            61 CCTGAAGACG  ATGGGAAGTT  ACTAGATGGC  AAGATTGGGG  ATATCAATGG  AACTAAAACT   120
            121 GACCAAAGCT  TAGACTCAAA  AGACAGCTTA  AAATCTACAT  CATATCAAGA  GAGTAAAACT   180
            181 AGTTTAAAAG  AAGAAGAAAA  GCCAGTAGAA  AGTAAATCAC  ATATAGATAA  AAAAGAAATT   240
            241 GTAGAAGATA  GTTCATTAGT  AGCAGAAGAA  AAGTTATCTC  ATTCAATCAT  ATCAGTTGAC   300
            301 ATTCAGAAAA  GCATGCCTTG  TGATACCAAA  GAAACAGTTC  CTCATGACAC  AAAGCCGGAC   360
            361 ATTAAACGCG  AAACAGATGT  GTCACCAGAA  GTTTTAGCTT  CAGTGGTTAC  AAATGCTGTA   420
            421 GTTAATGAAG  CAGCCTTGAC  GGTTAGTGAA  ACAAATGGTG  TGACTGTAAA  TGGTTCAACA   480
            481 ATTACTAAAG  ATTCATCCAA  AGTAGATGCC  GTAGTAGAAC  AAGAATTAAC  TAAAATAAGT   540
            541 GACTCTAAAG  GTGTAAAAAC  CGATGCAAAA  TCTTTAATAA  CATCAAATGG  TGATTCAAAG   600
            601 CCTATGCTTA  ACGGTGATAT  AGACCATTCT  CCTGTCCGCG  ATGGTGTTTC  AGATGTGTCT   660
            661 TCAAAATCCG  ACAAGGATAT  TAGTTCGAAA  CAAGAAAGTT  CAGTGTCTTT  AAAGGAGGAA   720
            721 ATACTGGCCT  CAGAAAAGCA  GGTATCAAAA  GAATCCGATC  AAACACAGGA  AACGGAAAAA   780
            781 TCTAAACAAT  CAGAGAGTAA  AGTTACAGAA  AAAATAGAGC  AAATAGAAAT  AGGATCTTGC   840
            841 AATGGTGTTC  CAGGGATAAT  AACTGTAGAA  TCTATTACTA  AAAAAGAAAC  TGTCAGCAGC   900
            901 TCGGTAGAGC  CTGAAAAACC  AAAAGCAGAC  ACCAGTCAAA  CAACAGAAAC  AAAACAAGAA   960
            961 ACAAAACAAG  AAGTAAAGCC  AGTAGATGGC  AGTTCTGTTG  TTGACAAAGT  AGCAGACAAA   1020
            1021 ACTGAGGAAA  AAGTATCAGC  AAAAGTAGAC  GAAGTAACTG  CTTCACCTAA  GAAAACTGAC   1080
            1081 GGGAAAATAA  GTGATAATCT  AACAGATAGT  GCTAAGTTGC  GCAAAGAAAA  TTTAACGGAT   1140
            1141 AATGCTAAAG  AACAAGTTAG  TGATTCTAAA  ACGGAGGAGG  ATAAAAAGAC  ATCCGTTGCA   1200
            1201 AAAGAGACCA  AGGAGGATAA  AGTTTCCGAT  GCAAAAGTGT  CCGATGCAAA  GCCTGAAGAA   1260
            1261 AAGAAAGATA  GTGGAAAAGA  AAAGGAAACA  ATTGAACAAA  AGGATAAAGA  TAGTAAAACT   1320
            1321 TCTTCTCCCG  CTAAGCGTCC  AGAAGTAACA  ATTTCGCAAG  TGCCAGAAAC  TACAGAAAGT   1380
            1381 AAAGTAAAGA  CAGACCAAAA  ACCATCAACT  GAATCCAAAG  AGGATGCAGA  AAAAGCAAAA   1440
            1441 CAGATTGATT  TATCCCAAGA  ACCCGTTAAA  CAAACCGAAG  AAAGCAAAGA  AAAAGATAAA   1500
            1501 AAAGATGAAA  AAGGTAAAGA  TATTTCAAAA  AGCGACACAG  TGGATACGAC  AGAAAAAGCA   1560
            1561 AAGAAGGCTA  ATGATAAAGA  TAAAAAACAA  ATCGTTGAAC  AAGAAGAAAG  TACTCCAGTG   1620
            1621 TCTGAAGACA  AGAAGGCTAG  CAAAGAACCT  TCAGAAAAGA  CGGATACAGT  GAAAGAAATT   1680
            1681 GATGAGCCTG  TGAACAATAA  AGAAAAGTTA  AAAGATGACA  AAGCAGAAAA  ATCTCCTTTG   1740
            1741 CATGATGTGA  AAGCTGAAAA  AGAAGAAAGT  AAAGGAGAAA  TCAAAAAAGA  ATCTGGTATT   1800
            1801 TCGAATGAAA  GGCTCGATAG  AGAAACTACA  GACACGAAAG  AATTATCTAC  AGAAGAAATC   1860
            1861 TGTGATATGA  CCGCAATGAT  GACTTCACAG  ATCCTTACTC  CAGCAGATCT  TGGAATAGAA   1920
            1921 GAAAGTACCG  AATCGTTAAA  GTCCGAAACT  GATGAAGGGG  AAAAAGTCGA  TTCGAAAGAT   1980
            1981 TTAACTTCGA  AAGAAAGCTC  TATATCGGCT  ACAATAGTTA  ATGGTAAAAC  CTGTGATGTT   2040
            2041 GCTGTGGGAT  TAGACGAAAG  AAAAATGGCT  CGAGTGGCAG  CACCAGATGG  AGAAGAAGAA   2100
            2101 GAAGTCGATG  GTCAGCAAGC  AAGTGCCGAG  GTAGAAGTAA  CAGAAGATGC  GACCGTCCCT   2160
            2161 AATGGAGAAA  ACGAAGGAGA  TAATCTCATA  ACTAATGGCA  CCGGAAGTCC  AGCCAGTGGT   2220
            2221 GCACCAAGTT  CGCCAACATC  TGCCAAATCG  TCTTCAGCAG  CTTCCAGTAA  ACCTGCTTCT   2280
            2281 GCAGCAAGCC  AAAAAGCAGA  ATCCAAAAAA  GAAGAGGAGG  TTAAGCCACC  TTCTGCTGTT   2340
            2341 TCCAGGTCCT  CCATTCCTGA  ACCTATTGTT  TATGAACCTC  CAGAAAGAAG  GAAATCAGCA   2400
            2401 GCATCCGTTA  CTAGTGATGG  TAAAAAAGAT  CCAGGCGCTG  ACAAATCCCA  ACTCGACGAG   2460
            2461 AAGGAATCGG  AGAAAAAAGA  TAAACAAGGT  GAAACAGATT  CTGCCAAGAA  ATCAAGGGAA   2520
            2521 GCCACTCCTG  AGCCAGATAA  GAAAGACGTT  GATAAAGATG  ACAATAAACT  TAAAGAGGAA   2580
            2581 GAAAAAGAAG  CATCTACTGA  GAAGGAAGAA  AAGTCTGAAA  AAGAAAGTGT  GTCTGGTAAA   2640
            2641 GCAACACCAG  CAGAGAAAGA  AGCAACATCG  GGAAAATCGA  CACCAGTAGA  GAAAGACGCA   2700
            2701 TCAGGAAAAT  CAACACCAAT  AGAGAAAGAA  ACATCGGGAA  AAGCAACGCC  AGTAGAGAAA   2760
            2761 GAAGCATCAG  GAAAATCAAC  ACCAGTAGAG  AAAGAAGCAT  CGGGAAAAGC  AACACCAGTA   2820
            2821 GAGAAGGAAG  CATCAGGAAA  ATCAACGCCA  GTAGAGAAAG  AAGTATCAGG  AAAAGCAACG   2880
            2881 CCAGTAGAGA  AGGAAGCGTC  AGGAAAATCA  ACACCAGTAG  AGAAAGAAAC  GTCTGGAAAG   2940
            2941 GCAACACCAG  TAGAGAAAGA  AACGTCTGGA  AAGGCAACGC  CAGTAGAGAA  AGAAACGTCA   3000
            3001 GGCAAATCAA  CACCAATAGA  GAAAGAAACA  TCAGGAAAAG  CAACACCAGT  GGAGAAAGAA   3060
            3061 ACATCAGGAA  AATCAACGCC  AATTGAGAAA  GAAACATCAG  GAAAATCAAC  GCCAATTGAG   3120
            3121 AAAGAAGCGT  CAGGAAAATC  AACACCAGTA  GAAAAGGAAG  TGTCCGGAAA  ATCAACGCCA   3180
            3181 GTAGAGAAAG  AAGAGGCGTC  AGGAAAAGAA  ACACCTTCCA  AGAAGGAAGA  TGCATCAGAA   3240
            3241 AAAGAAACAA  CTGCTGATAA  AGATTCTGTT  TCGGAGAAAG  AAGATATTTC  TCAAACAAAA   3300
            3301 TCTGCTTCAG  AAAAAGAGGC  CGTCACGGAT  GAAAAAGTTT  CTGAAAAGGA  AACATCTGTC   3360
            3361 GAAAAAGAAA  TTGCACCTGA  GAAAGTGACG  ACAGATACAA  AAGAAACTCC  TGAAGAAAAT   3420
            3421 AAAGAAGCTT  CAGGAAAGGA  AGCACCTGCT  GAAAAAGAAA  TATCAGAAGA  GAAAGAAACT   3480
            3481 TCTGTTGAAA  AAGAAGCATC  GGAGAAAGAC  GCCGTCTCGG  AAAAAGAGGA  AACCCCAGAA   3540
            3541 AAAGACACAG  AGAAACAAGG  AGATGGCGAA  AAGGAATCAA  CGAAAGAGGA  TATGGCCGAA   3600
            3601 TCTTCTAAAG  CTGAAAAAGA  ATCTTCTGAT  AAAGAGAAAG  GAGAAGAGGA  TGCAACAGAA   3660
            3661 AAAGAAAGCG  TTGACGAAAA  TATAAAAGAA  TCAGAAGATG  TCAGTAGCAA  AAGTGAAAGC   3720
            3721 GACACAAAAG  AATCACTTGT  TGAAAGTGAA  AAAGAGGTTC  CCAAAGAAAA  AGATTCGAAA   3780
            3781 GCAGAAGAAA  GTACTGAAAA  AGAAGAAGAA  AAAGGAGAAA  CAAAAGAAGA  AGAAGAAGCA   3840
            3841 AAAGGTGAAG  GAAAAGAAGA  AGAAAAAGAA  GAAGAAAAAG  AAAAGTCAGA  GGAGAAAGAG   3900
            3901 GCAGAACCCG  AAGCCGAAGC  GAAGGAAACG  CCAGAGGATA  CTTCTGAGAT  TAAGAAAGAA   3960
            3961 TCCCCCGCTA  GTAAATCACC  CGAACCAGCA  GGTGCTGAGG  AAAAGGACTC  GGAAACTGAA   4020
            4021 GCAGCTGACA  AAGAACCAGA  AGAGGCAGCT  GCTGCTGTAC  CCGATACTGC  TGAGAAAGAT   4080
            4081 GAAAAAGAAG  AAACTAAAGA  AGAAACAGTA  GAGGCTGCTG  AGGAAGAGAA  AGCTGAGGAA   4140
            4141 AAAGAAGAGA  CTTCAGAAGA  ACCAAAAACG  TTGATTGAAG  AGTCAAAGGC  CGAGGAGATT   4200
            4201 TCAGAAAAAG  AAACGGCTAA  GTCCGAAGAA  AAAGAGGAAG  ACGACACAGA  GAAAGAAGCT   4260
            4261 ACGCCAGATG  AAGAGGAGAA  AAAAGAGGAA  AAAGATGAGG  ATAAAAAGGA  TGAGGAAATT   4320
            4321 GCAGAAGATA  AAGGAGAGGA  AAAGGAACCG  GAAGCAGAGG  TTGCCGAAGG  TGACCAAGAA   4380
            4381 GAGAAACCTG  AAGATAAAGA  TGAAGGAGAC  CAAAAAGAAG  AGGCAGATGT  AGAGGCAGAA   4440
            4441 AAAGGAGAAA  AGGAGACAGA  AGAACAGGAA  AAGGGGGCAG  AAGAAGAAGC  TGCCACTGAA   4500
            4501 GCCAAGGAGG  AAGAAGAAAA  AGGAGAACAA  GAAGAAGGAG  AGGAGAAAGA  GAAAGCTGAA   4560
            4561 AAAGAAGCCG  AACAGGGTGA  GGAGCAAGAA  AAACAAGATG  TAGGAAAAGA  AGAAAAAGAA   4620
            4621 GAAAAAGCTG  AATCACCTCC  ACCGAAATCT  CCGACTAAGC  GGTCAGGCTC  TCCAACGAAA   4680
            4681 GGCGGAAGAA  GAGGTGTATC  TCCAATAGCT  TCACCACCCA  AAGCCCTAAA  GAAGCCACAA   4740
            4741 AAGTCCACTT  CGCCGAAGAA  GAAAAATGGC  ATGCTTTCTC  CAATAAAAAC  TCCCAAAACA   4800
            4801 CCTGGATCAG  ACGGAAGAAA  ACTGCCTCCA  ATCAAAGCTC  CTGTAGGATT  AGCACCAAAC   4860
            4861 CCTAACTTAA  AGAACATTCG  ATCAAAGATA  GGATCCTTTG  ACAATATACG  GTATAAACCT   4920
            4921 GGAGGTGGAG  ACAAAAAGGT  AATTACAAAG  AAACTTGAGT  GGAAGGCAGC  TCCCAAAATT   4980
            4981 GGATCTCTAG  ACCACTCACA  CAAAGGAAAG  CATGGAAAAG  GTTCTAAAAG  TGAATCAAAA   5040
            5041 GAAGGAAAAG  TAGTCGATGG  TCAGAGTCCT  TTGCCATCCG  GTGATGAAGG  TGATGGAGAG   5100
            5101 GGAACTGCTG  CAGGAGTTGC  AGAAACTCTT  ATTAAGCCAG  ACGGAGCAGG  TTCTACAGAA   5160
            5161 ATGCCATCCG  CGATAGCTGC  TGAATCT         5187
Single Nucleotide Polymorphisms
798T= 0.56C= 0.43A= 0.01 
990C= 0.68T= 0.31G= 0.01 
1142A= 0.58G= 0.42  
1289C= 0.53T= 0.46A= 0.01 
1326T= 0.60C= 0.40  
1512A= 0.85G= 0.15  
1646A= 0.52G= 0.48  
1783A= 0.70G= 0.30  
2076G= 0.67T= 0.33  
2548G= 0.82A= 0.18  
3294A= 0.90G= 0.10  
3298A= 0.76G= 0.24  
3760C= 0.80A= 0.20  
3869A= 0.78T= 0.22  
4137G= 0.86A= 0.14  
4363G= 0.75T= 0.25  
4364C= 0.74G= 0.26  
4501G= 0.71A= 0.29  
4581G= 0.78A= 0.22  
4752G= 0.67A= 0.33