CSH_0145_Complete Single nucleotide polymorphisms
            1 ATGCAATGTA  AGGGTGATGT  AAAAGAATTA  AATTCTGATA  TTAAATTATC  GAAAGGTGTT   60
            61 AAAAATATTT  CAATTATACA  TGATGCAAGT  ACATTTGATT  CTCAACACAG  TTTACGGACA   120
            121 GATTTATCAG  TCAAAGATAA  TTATAATTTA  TTACATTTAG  ATAATAATGA  AATGTTTTCT   180
            181 GTTAAAAACT  CTGTTAGTTC  TAGTTCTGTT  AATTTTACTG  AGCCACAGTT  ACCAAGAATG   240
            241 CACCTTGATT  CTCTCTCTGA  AGGTACCCGC  AACTTTTTGA  ATGAATTGGC  AGCATCTAAT   300
            301 TCTACTAATT  CATTTAATGA  TAATATTAGT  GGTTATGCCT  TATCTTCTAT  CAATTCGCCA   360
            361 CTGTTATCTT  TAAAATGCAA  AAAATCAGCA  GAATCCAATT  TTAATGTTGC  TCATAAAAGT   420
            421 AGTACTATAT  CAACTGATGA  TGAGAATGCA  TTGTGTAATG  AACTTAAGGA  TGGTAATAAG   480
            481 GATGTAATTA  AAACACTTTG  TACTATTAAT  AATGATAACA  GGGAGGAAAC  AAGTTCACAG   540
            541 TGTTATATTA  ATGAAGAAAA  TAAGGCTGAA  ATTAGTGCAA  TTTGTAATAC  TAGTGTTGAA   600
            601 AACAAGGATA  TTACTGATGT  ATTTTGTGAT  ATTAGTAATG  AGAACAAGGA  TGTGACTAGT   660
            661 GTGCTTCATA  ATATCAGCAA  TGAAATAAAA  AATGTGACCA  ATATACTAAG  TGATATTAAT   720
            721 GATACAGACA  ATGATGTTAC  CAAATCACTT  AGTGATATTA  ACGATGAAAA  TAAGGATGTG   780
            781 ACAAGTGCTC  TTGATTTAAT  TGAGCAATCT  TCATTACATG  ATAGGAACCT  TTCATCTGCT   840
            841 GAAATATGTA  ATAGCTTAAA  TCAAATATTT  AATGAAGCTA  CTGCAGATTT  GCCTGCAAAT   900
            901 GCAATTTCAG  TTGCTGAAAG  TAGTCAGGTT  GGTGAGACTG  ATGTAAACAC  AGAAAATAAT   960
            961 TCTATAACAT  TGTGTATGAA  CAATGAATCT  GAAATTTATT  TACAAGCTGT  TGAATCTGGC   1020
            1021 ATCAGTCTTA  CGGCAGATGA  GACAGGTACT  ATCAACCTCT  CTGATTTAAA  TTCAGGAAAT   1080
            1081 AATGCTGAAT  TTTGGCAGCG  TGTTTTGTTA  GTGCAAGATG  AAACAGGCAA  TATAGAAACT   1140
            1141 GTGTTTTTAT  TACAAGATAA  AGCTGAAGAA  GGTCTGTCTT  CAGATATAAG  TAATGGAAAT   1200
            1201 ATAATGTCAG  AAAATACTGC  AGAAAATTCT  CAAAGTAGCC  AGTGTATGAT  CATTGACAGC   1260
            1261 AGTTTAGTTG  ATGGTGTATC  AAATGAAGTC  CATAATTTAT  TAATTACTCA  AGATACTGCA   1320
            1321 AATAATGCTG  AAAGTGTCTT  AGAAACTCAA  GATGCTGATA  GTGGGCAGCA  TCTTGGACTT   1380
            1381 GAAGTAGTAG  ATTCTGCAGT  TGATGAAAAC  TTATTAACAT  CACAAAATAA  TGTGGATGTA   1440
            1441 AATCAGGACA  GTTTAAAAAT  AGGTAACATT  TCTGAAGAAG  CAAAAAATCA  GTTAACTGCA   1500
            1501 AATACGAAAG  AAAATATTTT  AAATGAACAA  GAAAGGAATG  TTAGTATAAA  GGTAAATTCA   1560
            1561 ACTGTAGAAA  CATCTCAAAT  TAGTTCAGCT  AATGATCAGA  CTTTGTCTTT  AAAACAGTCT   1620
            1621 TCAGCTAACC  TTTTAAATAA  TGAAGAAGCT  CCATCTGTTT  GTACTGAAAA  GTTAGTTGAT   1680
            1681 GTTAGCTCTC  AAAAAGAATT  TAACTATAAT  GGAAAACTAA  ACAGTTCTAG  TGAAATTTCT   1740
            1741 GTTCGTTTAA  ATGAACCTGA  ATCTAATGCT  TGTTTTAACC  AGCATTCAAA  AGCTAAAAAA   1800
            1801 AGTGTTTCTC  ATGGTTTATC  AGTCAGAAAT  AAATCAGTAG  AGGATTTAAT  TCAGTATACA   1860
            1861 CAGATATTAA  ATAATGTAAC  AGATAAATCA  AATATTTATA  AAACCACTAC  AAGCCATATA   1920
            1921 AATGGAGCTA  TTTATCATTC  TGAATCCAGT  CATATGCCAT  CAACAAATGT  CCAGAGTTGT   1980
            1981 GATCCAGAAG  GAAACCTATC  AAAATTAGAT  GAATTAGTTG  AAAGTAAACT  TAGTTACAAA   2040
            2041 CCACTTCCAA  AATCAAGAAA  ATCTTTCCAC  CTAAGTATTT  TTGGCAGATC  AGCTAGAAAA   2100
            2101 AGCTTGTTTG  GTTCAAGACT  TAGTAATTCA  TCAATAGATT  GCTGCGATAT  GGACTTATCA   2160
            2161 CAAACATGCA  ATGAAAATAA  TTCTGAATAT  GCAGAAGTGA  AAAACATGGG  GATAAAAAGG   2220
            2221 ACTGTGGACA  GTGAACACGT  CCAAGATATT  AAGCGTTTGA  AGACAGATCA  TATTGATATC   2280
            2281 AGTGATGATG  TGAATTGTAT  TTATGTGTCT  AAAAGTCGTA  CTGTAGCTCT  GAAGACTTTC   2340
            2341 AAAAAACCTT  TTACCGCTGC  AAGAAAATCT  GTGTTAGACT  CGAGAGAAAT  ATTAAAGAAT   2400
            2401 TTACGAAACA  CTGCTATGAA  AACATTTGTG  CCAAAAACAC  ATAAAGCTCA  AAGTGCATTA   2460
            2461 AAGACTTTCT  CACGGAAACA  AGCCCCTGTT  GTATGGAATG  AAACTCCGCC  TACAGATAAT   2520
            2521 ATATTGTCAA  GAAATGTTCC  TGAGAAAAAT  ACAAAACAGA  GCTATGGAAA  TCAGTCTAAT   2580
            2581 TCTCAGACGA  AGGTTTTTCA  GCCAGAAATA  TGTGAAATTA  GGATTTTGCC  AAATGATTAT   2640
            2641 GTTCAAAGAG  CTTCACAATT  ACTATTAAAT  GCTGAGAATG  TCGAACCTGC  TAGTACACCC   2700
            2701 GAAGATAATG  TTTCTGAGGA  AGAAATTAAA  CTGCCATCTG  GATGTACTTC  ACCTGTTAAA   2760
            2761 GAATTTTTGC  CTCTTAAATT  TCACTGTTAT  TGTGCTGCAA  AGGAGGTGCC  ATGTATATGT   2820
            2821 AATGATGGAA  ATCTGCAATT  AACTTGTGAG  GCAGAGGATT  CTATTGATGG  AAATCCTGTC   2880
            2881 CCTTGTACAA  ATATTGTGTC  ACAACATTAT  CTGCTTGCAC  CTTCTCCAGA  AGTAAGGTAT   2940
            2941 CGTGTTTTTT  GCGATAATCA  TTTTTGGAGA  CTCCGTGAAC  ATCACTGTTG  TCCAAATTGT   3000
            3001 GGCATTTTTT  GTTCCCAGGG  GGAATTTTTG  TTGTGTTCTT  GTGAAGAAAC  AGAAAAGAAG   3060
            3061 GAAAACCATT  TATTCCACAC  AAATTGTTCA  ATTGTTGTTT  CTCCTGGTTT  GCCTCCCAGT   3120
            3121 TGCCCTCATT  GTTGTAAATT  TTCTAATTTT  AATCCTGTGC  ATTTAATATG  TAGATCTGCT   3180
            3181 CAATCAGAGC  AGAAAGAAGT  GCCTTCTCAT  TCTCAAAATA  TTACAAGTAA  TCTTCAAGGC   3240
            3241 TGTGACATAT  TTTTAATTCC  TAAACCAGAT  TCAGAGCAGC  AGGTGGAGCA  GGGGGATTCT   3300
            3301 ACAGTGTTTG  TTCCAGATAA  GAAAGAACTT  CGTGTAATGA  TAACATCTTT  GGCAAACGAA   3360
            3361 AGATCGTTTC  GTCTTCGTCC  AACTGGAAAA  TGTTTATATA  ATCCTATCAA  AACTGGTGAT   3420
            3421 ACTCAAAAAG  TTATGCAGTT  GATTGGTAAT  GGTGTAAATC  CAAATCACAA  GTTCAGAAGT   3480
            3481 CATAGCAATA  ATGCACCTAT  TCATGTAGCT  GTATATTATG  GCTGGACTGA  AATTCTTCAT   3540
            3541 ATTTTACTTC  AGGCTGGAGC  TTTCAGAGAT  TCAGTGAATG  ATGATCTTGA  AACTCCACTT   3600
            3601 ATTGTAGCTG  TGGAGAGGAA  TAATCTCTCT  ATAGTTCATT  ATTTGGTCAT  GGCTGGTGCA   3660
            3661 CAGATTGATG  TAAAGGATTG  TAATGGTATG  ACAAGTTTCC  ATATAGCATC  TAAAAATGGC   3720
            3721 TTCAAGGAAA  TAGCAGAGTT  CTTGTACAAC  ACAGGAACAG  TTGACATCAA  TCTCCAAGAT   3780
            3781 GATGGAGGTT  GGACTGCATT  AGTTTGGGCA  AGTGAACATA  AACATGTTGA  CTTTGTGAAG   3840
            3841 TGGTTGTTAG  ATATTGGAGC  AGACCCTAAT  GTGCGAGATA  ATGAGGAAAA  TACAGTTTTA   3900
            3901 CACTGGGCAG  CATACTCTGG  AAAGTCTGAG  ATTGCAGAAC  TGCTGTTAGA  CAAGGGCTGC   3960
            3961 ACATTAAGTT  ATGTCAATAA  GAGGGGAGAT  TCTGCCTTGC  ATATTGCTGC  ACGTGAAGAT   4020
            4021 AATTATGAAT  GTGTGAAGTT  ATTCATAAAA  AGGGGTGCTG  TTGTTGATCA  GAAAAATAAG   4080
            4081 GAAAATAAGA  CCCCTTTAAT  GTGCTGTCAA  GATGATTCCT  TGTCATTTAA  CTATTTGTGC   4140
            4141 CAATCTATAT  CATCTGGTGC  TTTAAAAATA  GGGAAGATGC  AATTAGAAAA  ACATGTTGTT   4200
            4201 TTCAGGGATA  TTTCACGAGG  AGCTGAAGCA  TACCCAATAC  AAGCCATAAA  TGAAGTTGAT   4260
            4261 GATGAGGAAT  TTATAATGGA  GTTTAGATAT  GTAGTCAAAA  ATTGTCATAG  ATCAGGAGTC   4320
            4321 AATATCAATA  TTGTCAGTAC  TGTAAACAAT  ATGCAGTTCT  GCACTTGTAA  AGATAACTGT   4380
            4381 GTCACCCGCG  ATTGTAACTG  CACATCTAAT  TCCAAATGTT  GGTATGATGC  TAGTGGATGT   4440
            4441 TTGACGAGTG  AATATGATTT  ACAGAATTCA  CCTGTCATAT  TTGAATGTAA  CAAAACCTGC   4500
            4501 CATTGTCCCA  AAACGTGTAT  TAACAGAGTT  GTACAGCAGG  GTTTGAGGTG  TCCATTACAA   4560
            4561 TTATTTCGAA  CCCGATACAA  AGGATGGGGT  GTTAGAACCT  TACAAGTCAT  ACCTAAAGGA   4620
            4621 GCTTTTGTTT  GTGAGTATGT  GGGAGAATTA  ATCACTGCAA  GAGAAGCTAC  TCACCGTGAT   4680
            4681 GATGACACAT  ACTTTTTTGA  TCTGGAGAGC  AAAGACTCAG  ATTATTGTTT  GGATGGTCGT   4740
            4741 TATTATGGAA  ATGTAGCCCG  TTTTCTCAAT  CATAGCTGTG  ATCCAAATTT  GATGGCAGTA   4800
            4801 AAAGTATTTG  TTGAGCATCA  AGATTTGAAT  TTTCCTCGAA  TTGCTTTTTT  CGCTGTTAGG   4860
            4861 AGGATACAAG  CATTTGAAGA  ACTATGCTTT  GATTATGGCT  TGGATTTTTG  GATTGTGAAG   4920
            4921 TGTCAAACTA  TTTTATGTAC  CTGCAACACT  GAGTCATGTA  AATATTCGAA  AGATACCATT   4980
            4981 GATGATACTC  TCACAAAATT  CTTTAAAGAT  ACCAGGAATG  GAGCACAGTT  TGAATCTGAG   5040
            5041 TCA             5043
Single Nucleotide Polymorphisms
55G= 0.80A= 0.20  
1508A= 0.81G= 0.19  
1744C= 0.87T= 0.13  
4206G= 0.65A= 0.35  
4308T= 0.57C= 0.43