CSH_0147_Complete Single nucleotide polymorphisms
            1 ATGCTAAGGC  AAAAAAATAA  GGAAATAAAT  AAACTCTTAA  GATTACCAAT  GGAAGCCCTG   60
            61 CCTGATGCTG  AGATTTTTGG  AGGAGCTTTA  AGTGCTGTGG  CTGATAATGG  ACCTTCTGAT   120
            121 ATGTCTGCTA  AGTTAAAACT  AATGAAAGGA  ATGGAGAGCA  TGTTCACAGT  TATGAATGAT   180
            181 ACTGAGGTTC  CACACCCAGA  AGATCTGAAA  ATTGTTATCA  GCCAGTTTGG  TAGCATAGCT   240
            241 GATTCAATAG  CTGGTTCTTT  GGCAGATTCA  AATATAGGAG  GGAATTTCCT  TCCCAGTGAG   300
            301 CTTAAAAAAG  CTCGGCTAGA  GCTGGACCAT  AATGCAACTG  AACCTAACTT  TTTTATTTTG   360
            361 TATGTTGAAG  GTAATAGGAA  AGAAGTTCAA  GAAAAATTAA  ATGGCCGTAC  AGTTGAAGCT   420
            421 GCTAAAAATG  ACCAAGAAAG  TAATGCAAAA  GTTATGGTAA  ACAAAATGAA  AGACATGGTG   480
            481 TCTAATATAC  AGCAAAACTG  TATGGAAGAA  ATCATGGTTG  GAGCAGATCC  ATTTTATGCT   540
            541 GAATCAAAGA  GTGGATTTCA  AATGACTATT  GTGAAAAACT  TTGCTTCCAA  TCTTACTGGA   600
            601 AGTGTCATTC  AACAAAGTGG  GTCATCTGTT  ACTTTACCTG  ATTTGTGCCA  AGTTCTTGAG   660
            661 GGTGAATGTG  ACAGTGGGGA  TCCAGCTTTT  GGAGTTCAAT  CTGTGCGCTG  GACACAACCT   720
            721 CTGGAATCCT  ATGGATCTGG  GTCTGAAAAC  TTGTCTGACA  GTTCTAATGT  AATTCAAATT   780
            781 GATATTACTT  CCCGCAATGG  TTCTGACGCC  ATTCAAATAA  CTAATTCTTC  AGAACCTTTT   840
            841 ATAATATGTA  TCCCACGTTC  AAGTAGCTCT  GAAAGCAACA  TGGAGTATGT  GGTTCCCAAA   900
            901 TTTTCAAGAT  CAGATGACAT  CTTGGTTTAT  CATACTTCAT  TCATAGATTC  TTCAGGTGTA   960
            961 GCTGTTACAG  TGAATATTGC  ACCAACTAAT  GCAACAGCTC  CCTTAGTTCT  TCTTTTCAAG   1020
            1021 TATGGAGAGC  AAGCATCTTT  GTTGGATTAT  GATGATATTG  TAAGAGTTAA  AGATATACCT   1080
            1081 TCTGAAAATG  GTCTTCATAC  ATTCATTATT  GGTGCTGAGT  ATATTACTGA  GCCTGAGAAG   1140
            1141 AATTTATCAG  TTGCTATTGG  CCACTTTTCA  AATAACACAA  ATATGAATAA  ATTTTTCAAA   1200
            1201 AATCCAAAAA  AATATGACCT  GACAGTAACC  AATATGACAA  ATGTGTTCAC  TTCAAACTAT   1260
            1261 TCAATTGCCA  TAGCTGCCAC  TGGTTGTTAT  TATTTTAATG  AAGAAGAAGA  AAAATGGAGT   1320
            1321 ACTGGTGGAT  GCAAAGTATC  TGGAATAGAA  CCTGATGTTA  CTTGCTGTGA  GTGTAACCAT   1380
            1381 CTCACCTCAT  TTGGAAGTGG  ATTTTTTGTA  GCTCCCAATG  AAATTGATTT  TAATTACGTA   1440
            1441 TTTGCACATT  CAGATTTTCA  AACAAATAAG  ACAATTTATG  CTACCCTTAT  TGTAATGTTT   1500
            1501 TCTGTGTTCA  TTATTTTACT  TATCTTTGCT  CGCTGGAAGG  ACAGGAAGGA  TGTTCAAAAG   1560
            1561 CTGGGAGCTA  CTCCTTTACC  TGATAATGAA  GCCTCAGATA  AATACATCTA  TGAGATATTA   1620
            1621 GTGTTTACTG  GGCACCAAAG  AAATGCAGGA  ACAAAATCAA  ATGTATTCTT  CATTGTTTCT   1680
            1681 GGAGAAGAAG  ATGAAACAGA  AGTCCGTCAT  CTTGCTGATG  ACAAACGTCC  AATATTGCAA   1740
            1741 AAAGGATCCA  TTGATGTTTT  TGTTATGGCT  GTTCCTCGGT  CTCTTGGTCA  ATTAAATTAT   1800
            1801 TTAAGAATTT  GGCATGATAA  TTCTGGCACT  GGCAAGTGGT  CCTCTTGGTA  TTGCCAATAT   1860
            1861 ATTGTGTTCA  GAGATGTACA  GACAGGTTTG  AAGTATGAAT  TTTTGGTGAA  TAGATGGTTC   1920
            1921 GCTGTTGAAC  ATGATGATGG  ATTGATTGAT  CGCCTCATTC  CAGTTGCCGG  AAGAGAACAA   1980
            1981 GTGACTGAAT  TTTCCCATTT  ATTTTCTACC  AATTCCCGCC  GAAACTTAGC  AGATCGCCAT   2040
            2041 CTATGGTTTT  CAGTGTTTTT  AAGACCACCA  CGTAGTCGTT  TCACAAGAGT  TCAACGAGTT   2100
            2101 TCTTGCTGTA  TGGCTGTACT  CTGTTTATCC  ATGTTGACCA  ATGCTATGTA  CTATCAAAGA   2160
            2161 ACAGCAGCCA  AACCAGGAAC  CGGTGGTTTT  AAGTTTGGTC  CGCTCTCTCT  TAGTCCTGAA   2220
            2221 CAGATAGCTG  TTGGAGTTGT  GACAAACTTA  TTGATATTTC  CCCCGACCTT  TATTATGATA   2280
            2281 TTTTTCTTCC  GAAAATCCCG  ACCCAAAAAA  TTACGTCCAT  CACGCATACA  AGAAGCTCTC   2340
            2341 AAAAAACAAA  GACAAGAGTG  GAAAAAAAAG  AATCCAGAAA  AGCCTCTTGC  AAAGCCTCGT   2400
            2401 ACCATGACTG  AAGCAGAAGC  TCAGTTGTAC  CATCGAAAGA  AAAAATTTTC  CCTCCCATGG   2460
            2461 TGGTGTGTGT  ATTTTGGGTG  GCTCTTTGTG  ATTGCCTCTC  TTGGATCTTC  TCTCTTCTTT   2520
            2521 ATTTGGGCGT  ATGGAATTGA  ATTTGGAGAT  GAGAAAACTT  CAAAGTGGCT  TACTTCTCTT   2580
            2581 GTTATATCAT  TTTTCTCATC  AGTACTTATC  ACACAACCCA  TTAAAGTAAT  ATTAATGGCA   2640
            2641 ATAGTGGTAT  CTTGCATGTG  TCGCTCCATT  GATTATGATG  AAGATGATGC  CGACGAGGAT   2700
            2701 GAAGAAGATC  CTCAACTTCA  GACGGATGAA  GTATATTTAC  ATGATCGCAA  GAAAAGTAAA   2760
            2761 AAAATTACCT  ACCGTCCAAT  GGACCTTGAA  GCATTGGAGG  AAGCCAGAAA  AGAAAGAGAG   2820
            2821 AAAGAAGTAA  AAATGTATAG  TGTGATGCGA  GAAGTCGCTG  CATACTTTTT  TTTCTTGTGG   2880
            2881 ATTATCATGA  TTCTTAGTTT  TGGAAACAGA  GACACTAATA  ATTTTTTTCT  ACGTGAAGCA   2940
            2941 TTGATAAATG  GTTTCGTTAA  GCCTGGAGAT  TTATGGGTAG  ACTATAACTT  CGTAAATACA   3000
            3001 GAAAGAAAGT  TTTGGAACTG  GACCCACAAT  GCACTGATTC  CTGAGTTGTT  TGCTGTGAAG   3060
            3061 TGGTACAATG  GTAGAGATCC  TTTAGGCTTA  CGGTTATTTC  TTGATGATCG  CAATAATCTC   3120
            3121 AAAATTGGAT  ATGCTGTTCT  TCGACAAGTC  AGGATAAAAC  CTAATAGCTG  CAAGGTGTCA   3180
            3181 TGGCTCTTCG  AATCTATTAC  GTCGGAATGT  GCTGGATTTG  GCAGTGTTGT  TTTTGAAGAT   3240
            3241 GGTACTCTTT  ATACGAAAGG  TTGGAGGACA  GTCAATTCCA  CTGACACACT  TGTGCCTCCC   3300
            3301 GAGTATAAAT  ATCTGTCTGC  GTCACAGCTG  AAGGGTTATC  CATTCTGGGG  TCAGATGGAC   3360
            3361 TGGTATGGGG  GAGGAGGATA  CGTTGTTGCA  CTTGTTTCTG  TGAGGGACAG  CGACGTCGTT   3420
            3421 GAGCTCAGTA  AGAAAGTAAA  AAGGCTTGAA  GTGGATGGTT  GGATTGATAG  ACACACCCGG   3480
            3481 GCAGTATTTG  TTGAATTTGG  TATCTACAAT  GCACAGATAA  ACCTCTTTTG  TGCCGTCACC   3540
            3541 ATTTTAGCCG  AGTTCCTTCC  AGGAGGTGGG  GTAGTACCCT  ATTACCACAT  CGACCCTGTG   3600
            3601 AGACTTTTGA  ACTATCATAC  TGGCTTTGGA  TTTTTCCAAA  TGATCATTGA  GATTATTTTC   3660
            3661 GTACTATTTA  CGATATTCTT  CACATTTAAA  GAGATAAAAA  AGATGGGTAA  AGAAGGTTTT   3720
            3721 TCATATTTCA  AAGAATTCTG  GAACATGGCG  GAGTTAGTGA  GCATAATCGT  CTCTTACACT   3780
            3781 GGCATTGCAA  ATCAGATTTA  CAAGCTGTTC  ATGACAGCTG  AAATTTTACG  AATATTTACT   3840
            3841 GAAACAGAAG  GCACTGGTTA  CGTGAAGTTG  CAGGAAGCTG  TGCTTTTGAA  CGATCTTCTC   3900
            3901 TGTTACCAAA  TTGGTTTAGT  GATGTCTATA  TCGACACTGA  AGTTTTTGAA  GCTGCTCCGT   3960
            3961 TTTAATAAAA  GGATCGGAAT  ATTGAGTAGC  ACATTACGCA  TGTGTGCGCA  TGAGCTGAAG   4020
            4021 AGTTATTCGG  TCTGTCTGAT  GGTGGTGTTC  GTAGCCTTCG  TCATTCTCTT  TTGGCTCCTT   4080
            4081 CTCGGGAGAT  ATGTCCGAGA  GTTTTCAACT  TTCGTGTACT  CTTTTGAATC  ATCCATCAGC   4140
            4141 ATGATGTTGA  AGAAGTTCAA  TTATGAAGAC  ATGTATGCCG  CTCAACCTGT  TTTCACGCCA   4200
            4201 ATTGCATTCT  TTACATTCTC  GTTAGCTACA  GCTGTGGTGC  TGGTAAACAT  TCTTCTGAGT   4260
            4261 ATCATCATCA  GGTCCTTTGA  GGACGTGAAG  CGCGATGTCA  GTTTGCAAAG  CAACGAATAC   4320
            4321 GAGATTTTAG  ACTTTTTCAT  TAATCGGATG  AAGATGATGA  TAGGCTGTGG  TACTGCAAAA   4380
            4381 GTTCGCCCTC  AGCCAAGCAT  GTACCGTGAA  CAGAAGAAAC  CAAAAGACAC  GGTTTCGTCT   4440
            4441 TTCCCAGACA  AAGTTGACAA  ACTAGTGGAT  TTCATTAACG  ACTTCTACTT  TGAGAATCAA   4500
            4501 ATGGATTTCA  ACAGTAAAGA  TTTCTTGAGG  AAAATGAATG  CTGACATTGC  TAGAGCCAAC   4560
            4561 GGGGTTGTTA  ACAGGGAAAG  GAAGAAAGCA  AAGCCAGTTA  AAGCTTTGAG  GAGCAAGATA   4620
            4621 CCCAAAAGTG  TTTCAGATCG  TTTTGATGAT  TTT       4653
Single Nucleotide Polymorphisms
11A= 0.60C= 0.40  
616A= 0.89G= 0.11  
1205C= 0.89T= 0.11  
1338A= 0.88T= 0.13  
1371G= 0.78A= 0.22  
2382G= 0.73A= 0.27  
2511T= 0.62C= 0.38  
2652T= 0.53C= 0.47  
2841T= 0.67C= 0.33  
3055G= 0.52A= 0.48  
3390A= 0.55C= 0.45  
3502A= 0.62G= 0.38  
3507C= 0.61T= 0.39  
3636C= 0.55T= 0.42G= 0.03