CSH_0172_Complete Single nucleotide polymorphisms
            1 ATGCCTGATA  TGAGCGCGAC  AAATGTTGAA  AATGCCGCTG  ATGCAACAGA  AGTCACCAAA   60
            61 AGTGCGGCAC  AGCTAAAAAA  AGAAGCGAAA  AGAAAAGAAA  AACTAGAAAA  ATTTAAGCAG   120
            121 AAGCAAGAAA  AAATTCAAGC  AAAATCTCAG  AACGTTGATA  AAGCCCCGAA  AAAAGTGAAA   180
            181 GAAAAGAAGG  AAAAGGAAGT  CCTTGTTTAT  GATAAAACTA  TAACACCTGG  AGAGAAAAAG   240
            241 GATATTTCTG  GTCCTATGCC  TGATGCATAC  AGTCCTAAGT  ATGTTGAGGC  TGCATGGTAT   300
            301 GCATGGTGGG  AAAAATCTGG  ATTTTTTAAA  CCTGAATATG  GAAATAAAGA  TTTTAGCCAT   360
            361 GTGAATGATA  GTGATAAGTT  TGTAATTGTT  ATTCCACCAC  CAAATGTTAC  TGGCAGTTTA   420
            421 CATGTTGGAC  ATGCTTTGAC  TAGTGCAATA  GAAGATAGCA  TTACACGGTG  GAATAGAATG   480
            481 AAAGGTAAAG  TAACATTATG  GAATCCTGGT  TGTGACCATG  CTGGAATTGC  TACTCAGGTT   540
            541 GTAGTTGAGA  AAAAAATTTG  GAAGGAACAG  CAGAAACGTA  GGCATGACCT  CGGAAGAGAA   600
            601 AATTTCATTA  ATGAAGTTTG  GAAATGGAAA  GAACAGAAAG  GAAATAGAAT  TTATGAACAA   660
            661 CTTCGTTTGA  TGGGTTGTTC  TGTAGATTGG  GATAGAGCTA  CTTTTACCAT  GGACCCTAAA   720
            721 GCCTGTCGTG  CTGTCACTGA  AGCATTTGTT  AGATTACATG  AAGAGGGACT  GATTTATCGT   780
            781 GCAAATCGAC  TTGTGAACTG  GTCATGCACT  TTGAAGTCTG  CCATTTCTGA  TATAGAAGTA   840
            841 GATAAATTAG  AGCTAACTGG  CAGAACACTT  CTGTCTGTCC  CTGGATATAC  TGAAAAAGTA   900
            901 GAATTTGGAG  TGTTGGTTTC  TTTTGCTTAT  CCTGTTGAAG  ATTCTGATGA  AGAAATAGTT   960
            961 GTTGCCACCA  CTAGAATAGA  AACCATGCTT  GGAGATTCTG  CAGTTGCTGT  ACACCCTAAT   1020
            1021 GATCCCCGTT  ATACTCATCT  GCATGGCAAA  TTTGTGTTGC  ATCCTTTCTG  TTCTAGAAGA   1080
            1081 ATGCCTATTG  TTTGTGATGA  CTTTGTTGAC  ATGGAATTTG  GAACAGGTGC  TGTTAAGATA   1140
            1141 ACTCCTGCAC  ATGATCCTGC  TGATTATGAA  GTTGGAATGA  GACATCAGCT  ACCATTTATA   1200
            1201 AATATTTTGA  ATGATGATGG  AACAATGAAT  AACAACTGCG  CTGAGTTTTC  AGGAATGAAA   1260
            1261 AGATTTGAAG  CTAGGAGAAA  GGTTTTAGGA  GCTTTAAAAG  AAAAGAATTT  GTACAGAGAC   1320
            1321 ACTAAAGATA  ATCCCATGGT  TGTTCCAGTT  TGTAGTCGAT  CAAAAGATAT  TGTTGAACCT   1380
            1381 CTATTAAAAG  TACAGTGGTA  TGTTAAATGT  GATGGTATGG  CCCAAAAAGC  TATGGAGGCT   1440
            1441 GTCAAAGAAG  GAAAACTGAA  GATTTATCCT  GAAGTTCATA  TCAAGACTTG  GAATCACTGG   1500
            1501 CTTGAAAAAA  TTAGGGATTG  GTGTGTTTCA  AGGCAGTTGT  GGTGGGGTCA  TAGAATTCCT   1560
            1561 GCCTATTATG  TGACAATAAA  GAATGCTCCT  CCAGCTGCAG  ATGTACAAGA  AGAAAATGAA   1620
            1621 AGGTGGGTAA  GTGGCAGAAA  TGAAGAAGAA  GCCAAAGAAA  AAGCTGCAAA  AAAATTCAAT   1680
            1681 GTTTCTCTAG  AAGATGTGGA  ATTGAAGCAA  GATGAAGATG  TGTTGGATAC  TTGGTTTTCA   1740
            1741 TCTGGACTTT  TCCCATTTTC  TATTTTTGGC  TGGCCTGAAC  AGACAACTGA  TCTGAAAGCT   1800
            1801 TTTTATCCTG  GAACACTCTT  AGAAACAGGG  CATGATATTT  TATTTTTCTG  GGTTGCTAGA   1860
            1861 ATGGTAATGT  TAGGTATTCA  GTTAATGGGA  GAGTTGCCTT  TTAAAGAGGT  ATTTCTTCAT   1920
            1921 TCTATTGTAA  GAGACGCTCA  TGGTCGAAAA  ATGAGCAAAT  CACTTGGAAA  TGTAATTGAT   1980
            1981 CCCATTGATA  TGATTAATGG  CATATCCCTT  GAGGCATTGC  ATGCCACTCT  TTTAGATTCA   2040
            2041 AACCTAGATC  CAAAAGAAAT  TGACAAAGCT  ACCCAGGGGC  AGAAAGCAGA  CTTTCCTAGT   2100
            2101 GGTATTCCTG  AATGTGGTAC  TGATGCTTTA  AGATTTGCTC  TTTGTGCATA  CACTGCCCAA   2160
            2161 GGTCGAGATA  TTAATCTAGA  CATAAATCGA  GTAGAAGGCT  ATAGACATTT  CTGTAATAAG   2220
            2221 CTCTGGAATG  CAACTAAATT  CGCTCTAATG  TCCCTTGGTG  ATGATTTTGT  TCCCAAAGAA   2280
            2281 AAATTCAAGT  TATCTGGAAA  TGAAAGTGTT  ATGGATATGT  GGATTTTAAG  TCGGCTGTCC   2340
            2341 TCTGCAATTA  AAACTTGTAA  TACTGGTTTT  GAAACATATG  ATTTCCCTGC  TGCTACTACA   2400
            2401 GCATGCTATG  CATTTTGGCT  CTATGATTTA  TGTGATGTTT  ATTTGGAATC  TCTAAAACCT   2460
            2461 GTGTTTCAAG  GCTCAGATAA  AGCTGCTGCT  GAAACCTCTA  GAGAAATGTT  ATATACTTGC   2520
            2521 TTAGACACTG  GATTAAGACT  TTTGAGTCCC  TTTATGCCAT  TTGTTTCCGA  AGAACTTTTC   2580
            2581 CAAAGATTGC  CTAGAAGAAA  GGGAGATGCT  ACTCTAAGTA  TTGTTGTATC  TCAGTATCCA   2640
            2641 TTGCCAGATC  AGTATCCGTG  GGAAAATGCT  GAACTGGAAA  AGTCTGTTTC  ATTTGCCTTG   2700
            2701 AACGTGATTC  ATAAAGTTCG  ATCCTTGAGA  GCAGATTATA  ATCTGCCTAA  AAATGAAAAA   2760
            2761 TTGGACTTAT  TTTTAAAGTG  CGATGATGAA  GACACCAAGT  CATCACTAAA  TAGTCTTCAA   2820
            2821 GAAACAATTT  TATTCCTTAC  ATCCTCAGCC  ACTGTTCATA  TTTCAGAAGA  GATTCCTTCA   2880
            2881 GGTTGTGCCA  TCACAACAAT  ATCTGAGAAC  TGTGAGGCTC  ATTTACTGCT  AAAGGGTCAC   2940
            2941 ATAGATGTTA  GTAAGGAAAT  CTCTCGGTTA  GAGCAAAAAC  AGGAAAAATT  ATCTTCCCAG   3000
            3001 ATCACCAAAT  TAAGACAAGC  AACTCAAGTC  CCAGACTATG  AAAGTAAAGT  GCCTGAATCT   3060
            3061 GTGCGAGAAT  CTCATGCAGA  AAAGATTTCA  TTGACTGAAG  GAGAATTAAG  CAAAGTGCTA   3120
            3121 CAAGCCATAC  AGACTCTAAA  AATTATGGAC         3150
Single Nucleotide Polymorphisms
828T= 0.80C= 0.20  
1079G= 0.67A= 0.33  
1281G= 0.63A= 0.37  
1415G= 0.82C= 0.18  
2202T= 0.71C= 0.29  
2781C= 0.64T= 0.36