CSH_0206_Complete Single nucleotide polymorphisms
            1 ATGAAGAATC  TAAAGCTCTT  AGATATACAA  AAGAAGGTGA  ATATTGAGGC  AGATTGCTTT   60
            61 TGTCATGACT  ATGATGGAAA  TACTTATTTT  GCTTCAGTCA  ATGAAATTTA  CTGTATTACT   120
            121 CAGGGATCAA  ATGATCTTTC  CTTGTGTGCA  GAACTATTAT  CTGACGTTGA  TGCATCCCAT   180
            181 TCATTGATTG  GAATTGAACA  TGTAATTGAA  ACTGATAAAT  TATTTATTGC  TTCATCTTCT   240
            241 GGAGAGATAT  ATTTATATGA  TATTTACAGC  CGAGAAGTAT  CTACTGTAGG  CATTGTTGAT   300
            301 TCTAAAATAG  AAGGATTTGC  TTGGAGCCCT  GATCAAGAGT  TTCTTGTCCT  CTTAACAGGT   360
            361 GCTAATACCC  TTATATTAAT  GACCAAGGAT  TTTGATCCAA  TAACAGAAAA  AAGCCTTTGT   420
            421 CCTGATGAGT  TTGGAGAAAG  TAAACCAATA  ACTGTTGGAT  GGGGCTCTAA  GGAAACTCAG   480
            481 TTTCATGGGT  CTGAAGGCAA  GGATGCTGCT  AAAATGAAGA  AAATAGAACC  CAAACCAGCT   540
            541 CTTCCTTATG  ATGATGGCCG  ACCAAGAATC  AGCTGGAGAG  GTGATGGAGA  ATTCTTTGTT   600
            601 ACTTCAAGTA  TACATTCAAA  TAAAGGTTTT  CGCCAGCTTC  GTATATGGAG  CAGGGAGGCA   660
            661 GTTTTGCAAT  TTACAAGTGA  AATAAGAGAT  GGATTAGAAG  AACCTATTTG  TTGGAGGCCT   720
            721 CTTGGTAACC  TTATTGCCTG  TAGTCAACAA  GATGCAAATA  AGCATAAGAT  TATATTTTTT   780
            781 GAAAAAAATG  GATTGCAACA  TGGAGAATTT  GCTCTACCTT  TCAAGCCAAA  TACTCATAAA   840
            841 CTTACTCATT  TGTTGTGGAA  CACAGATTCT  AGAGTATTGC  TCATAGTAGC  AGAACTGATT   900
            901 GAAGATCCAT  CTGTTTTTCA  AATAATGCTG  TGGACTTGTG  GAAATTATCA  CTGGTATATG   960
            961 AAGCAAAGTT  TTTGCTTGCA  AAAAGCAGAT  GTTCAGAAGT  CACTTACCAT  TAAGTGGAGT   1020
            1021 TCTCGCCATC  CGTATGAACT  TTTTATCTTG  AATCAGACTA  CCAAAAATTT  TTATGCAGCA   1080
            1081 AAATGGGCTT  TTTCAATATC  ATCTAGTGTT  AGTGAAAGCA  GTGATGCAAT  AGTGGCATCT   1140
            1141 ATAGACAATG  ATAACATTTT  AATCACACCT  TTTGTCAAGA  TGTTGGTGCC  ACCTCCAATG   1200
            1201 TGTGCATATT  CCTTCAGCTT  TCCAACAGCA  GTTCAAAGTG  TCTGCTTTGC  ACCAGAGTCT   1260
            1261 CCAGAATTTT  GTTGTTACTT  AGGTGACTTT  AAGTTGGCTT  TTTTTCAGAA  AGGAAGCAGT   1320
            1321 AATGAAGACA  CTAAGTCATC  TGAGGAATGT  GAATTAAAAT  TAGTTGCAGC  AGGTGGCAAT   1380
            1381 GGCTTTAAAT  CAAAAGTAGA  TCCATATAAT  TTCAGAGGAA  TTGTGAAATT  CAATGTGAAT   1440
            1441 GGCCTAAAAA  CTTGTGAATT  TGGATTTTGC  CACTGGACTT  GGGTTAAGGG  AAATAGGCTT   1500
            1501 CTCTGTGTCT  GTTCATACCT  ACAAAACACT  ATACCTTCAT  TTGCTTTAAT  TTTATTTGAA   1560
            1561 CTTCCAGAAG  TTTTGATGCC  AGAAAAGGAA  CTATCTGGAA  GGCATTTGAC  AAATCTGGAG   1620
            1621 TGTTCAGTGA  CTGGAATTTG  CACAGATAAA  TCTGGAAGTG  TTGCTGCCAT  ACAGCTCACA   1680
            1681 AATGGAAAGA  TTTTGAGGCT  AAATATTGAT  GAAGCAGTAA  TTAGTGCTGA  AGGTTTTCTT   1740
            1741 GTCCCATGGT  TTTGTGATGA  TGGTAGTCCC  CTTACTTTAC  CCCAAGCATG  TATGACTATG   1800
            1801 TCTATTATTT  CTATTCAGGG  AAAGGAATAT  TTCTTGGGCT  TAAGTGAGCG  GTTCAGTTTG   1860
            1861 TATTGCAATA  AAACTGCCAT  ACTTTCTAAT  TGCACTTCAT  ACTACATTCA  TGATGAATAC   1920
            1921 TTATTAGTAA  CCACAACAGA  TCATGTTTTG  AAGTTCTTCT  TGATTGACTG  GGATTTAGCA   1980
            1981 GATCTTAATA  GATCACAGCT  GGATTCTATT  GTACAAATTC  AAAGAGTAGA  AAAAGGAGCT   2040
            2041 AAAATTATCA  TTGCACCTCT  CACTGGCACC  AAAGTTATAT  TACAGATGCC  TAGGGGAAAT   2100
            2101 CTAGAAACTC  TTAACCCAAG  ACCTCTTGTG  CTGTCATGTG  TTTGTAAACA  TCTTGATAAT   2160
            2161 TTGCAGTTTG  ACAAAGCATT  TGATATATCT  AAAGTTCACA  GAATTGATAT  GAACATTCTT   2220
            2221 TATGACCATA  ATCCTAAAGC  ATTTTTAGAC  AATGTGCAAT  TGATAGTTGA  CCAATTACAG   2280
            2281 TCTTCAACTA  ATCTTAATCT  TTTTCTGGCT  AGTTTAAAGA  ATGAAGATAT  ATGTGAGACT   2340
            2341 TTATATCCTT  TAGCCTATAA  AGGAAAAACA  CGCCCAGTTA  AACCAGATTT  AGAGAGTAAT   2400
            2401 AAAATTGATG  TAATATGCAA  TTCTATCCGT  GAAGTGCTTG  AGACAAATAA  TGATAACAAG   2460
            2461 TTATTCCTTT  CTCTGATTGC  AACATATGCT  AAGAAAAGTG  AACCTGAGTT  GGAGCAAGCT   2520
            2521 CTAATAAGAT  TGAAAGGAAT  GAAAGATTTT  GATCCAAAGG  GTAATCAGGC  TTTAGTGGAC   2580
            2581 AGTGCTCTTA  ATTTCTTATT  ATATTTAGTA  GATGTCAATG  AACTAATTGA  TGTTGCACTT   2640
            2641 GGAACTTATG  ACTTAGAAAT  AACTGTTATG  GTCGTACAAA  AATCACAAAA  GGACCCTAAA   2700
            2701 GAATTTTTAC  CATTTTATAA  TGAATTACAA  AGTTTGGAAG  AAAATTTTAG  GAAATATAAA   2760
            2761 ATAGATATGC  ATCTTCAACG  ATATAAGCTG  GCACTGCAAC  ATATTAGTAA  ATGTGAAGAG   2820
            2821 CACTTTGACA  AATGTTTGGA  CTTAATTAGA  ACTCAAAGAC  TGTATATTGA  TTCCTTATAT   2880
            2881 TTATTTCCAC  CTTCTTCTGA  TCGATATAAA  GTTGTGTGGA  AAGAATATGG  AAATTACCTT   2940
            2941 ATGGAAAAGA  GATATTTTGA  TGAAGCAGGT  CTTGTATTTA  CAAGGTGTGA  AGATTATCAG   3000
            3001 AAAGCACTGA  TGGCTTACAA  GGAATCACTG  AACTGGCAGT  CTATGTTATG  TGCTGCTATG   3060
            3061 CATTTGAGTT  ATTCAGATGA  TCGAATAATT  GCTTTGTGTA  TTGAAGCAGC  AGATAAACTG   3120
            3121 AAAAGTAACC  AAAAGTATTT  AGAAGCCTCA  TATTTATTAG  AGCAGTATGT  GAAGGATATT   3180
            3181 GAAGATAGTA  TTGTCACACT  TATAGAGGGT  TGTGAGTGGA  ATGCTGCGTT  ACTTTTGATG   3240
            3241 TCCAAATATA  GACGCCATGA  TATAGCTGAA  ACTCATTTGA  AGCCAGCTCT  GCAAGAACAT   3300
            3301 TGTTCATTTT  TGGAGTCCCA  TTTAGAACAA  CTGTCTAAAG  ATTTTAGGAC  TCATACAGAA   3360
            3361 AGACTAAATG  TTGTAAGGTC  TCAAAAACAG  AGAGAGGCTG  AGTTACCTGA  CATTATAAAA   3420
            3421 CATCATGATG  AAGAATTATT  CTCAGAAACA  GATAGTGTTG  CTGATGTGGC  ATCATCTTGT   3480
            3481 GCTGGATCTA  AGCAGTTATC  TGGGTCTATC  ATGACAAGAA  AAAGCTCAAA  AAGTAGGAGA   3540
            3541 AAGCAAAAAC  TTAAAAAGTA  TCGCCTTAAA  GAAGGTAGTC  CTGATGAAGA  CCTGGCTCAT   3600
            3601 ATTGCTGCTT  TATCTGAAAT  TGTTATCAAG  ATAGATAATA  TAAAAGATAA  CTTCCTAAAT   3660
            3661 ACCTTGAAAA  CACTAGTCCA  GTTTGGAAAT  GACCAACAAG  CTAAGTTCTT  ACAGCATGAA   3720
            3721 ATGACCAACT  TAGTTGCTTT  TGTGGAATCT  GAAATTCCTA  ATATTTGGTT  ACCTGTTGAA   3780
            3781 AAGGATTCTC  AAAAGTCAGA  CATGATATTT  GGTCCTGACT  CCACTGCAAA  TTCCATTACT   3840
            3841 GCACTTTTAC  AATCTGAGAA  AAAGAATCCT  CCTAAAGCTA  GAACAGATCC  AGAATTAGCA   3900
            3901 CCACCTCCAT  GGAGAAAACT  TGATGTGTCA  CTTCAGATGT  TTAAG     3945
Single Nucleotide Polymorphisms
93T= 0.87C= 0.13  
560G= 0.54A= 0.46  
657G= 0.64A= 0.36  
686G= 0.55A= 0.45  
738C= 0.82T= 0.18  
747A= 0.78G= 0.22  
989A= 0.75G= 0.25  
1068T= 0.80C= 0.20  
1470C= 0.66T= 0.34  
1485T= 0.74C= 0.26  
1529C= 0.88T= 0.13  
1953G= 0.68A= 0.32  
1962G= 0.68A= 0.32  
2150A= 0.74G= 0.26  
2862G= 0.56A= 0.44  
2915T= 0.79C= 0.21  
3279G= 0.57A= 0.43  
3485G= 0.77A= 0.23  
3546A= 0.84G= 0.16  
3852A= 0.77G= 0.23