CSH_0485_Complete Single nucleotide polymorphisms
            1 ATGCCACATA  CAACTTCAAG  TGACGTAGCT  CCCCCACCAA  TAGGAATTCC  CACGGTGGAC   60
            61 GTGTGGGACG  ATCCCCGAAG  CCTTACGACC  TTTCGAACAT  TTCATCATCC  GAACGGCAAT   120
            121 GGAAACGTGG  CCGAAACTTC  GTTCCATTCC  CAAGCAGAAG  GGAACAACGG  CATTCAGCAT   180
            181 AACGGTGGCA  ATGAGTCGGA  CATCAACAGA  AATGGAAATC  AAAACCTGCA  CACGCTTTCG   240
            241 AACGAAAACG  TGCTGAGGAA  TAAGCTCGGA  AACTCCAAAC  TGAAAGCGAA  AATATGCACT   300
            301 CAGGTGAAAC  CCGTGACTCC  CCCTCAAACG  TTCAAGGTTA  TTCCGAAATT  CGACAAAACA   360
            361 GCGACCGCAG  ATGATGATTC  GAAATCTTCG  AGCAACGTAC  CCACAAGTAC  ATTTGCCCCA   420
            421 GTTAATGCCG  TTCTGAATAA  CAACGTGACA  AATCAAAATC  CCGAACTTAT  TGCGAAAGAA   480
            481 GACAGTTCGA  AATCAGGAAA  CGGTTCTCAC  GTCACGGAAA  ACGGAAATGG  GAATGTACAT   540
            541 TCCGTGAAAG  GATTCCCAGA  ATCAAACAAC  GGTGTCGACG  TCATAACTAT  AGATCTGGGG   600
            601 CCAATAGACA  AAAGGTTCGG  ATTTTCAGTA  GTGGGTGGAT  GTGACGAAGG  ATTTGTACCC   660
            661 CGCATTGAAA  ACATTACTCC  AGGTTCTCCA  GCTGATAAAG  CTGATCTCGA  AGTGGGAGAC   720
            721 GAGATCTTAG  AAGTGAATGG  AAGGTCTCTG  GACAATTGCA  CTCACACCGA  AGTCATTTCA   780
            781 CATATTCATC  AGTGCATACG  GTCCAGGACG  ATATGTCTGC  GGGTGAAACG  CAAAACAAGC   840
            841 TGCAAATTGG  CTCTGGACTT  GGCCAAAAAC  AGTAGTGTGC  AAGATGCCTT  TGTCATTGCA   900
            901 GTGGAACAGC  AAGCTCGAGA  AAGATTGGAG  CGATTATCTG  CTCTCAAAAA  AATCAAGCCA   960
            961 GTGGACATGA  CTAAACTATC  ACAGGAACTT  AATGAATGCA  CTAATAGCAC  CCCTGAACTG   1020
            1021 AATGGTGTTA  TTGAAAATAA  TCCTATCTAT  GTTACCACTG  TGCCTGAAAT  TCACAACGCT   1080
            1081 ACACTGGAGA  GAGTGAAAAA  AGATAGACTT  AACAATCATG  TTAACAGCTC  TTCAGTTCCA   1140
            1141 GTATCTAATA  AACCAATATG  TGATCAAAAC  ATGCCTAGTG  TAAATGGTCA  TAATCAAGTC   1200
            1201 AGCACTGATT  ATGATACTCA  TGATCAGGAA  TTAGAACTTA  AACAAGAAAT  TCTAGACAGA   1260
            1261 GAGGAAGAGG  ATGATATTTT  TGCACCGCCT  TCACCAAGAA  CTCCACCTCA  TGAGAGACTT   1320
            1321 CTCATTGAAT  CCCAGAATGA  GAGAGACTCT  GTAACAACCA  ATTTTTCACA  AGACTGTGTA   1380
            1381 TCAGTTGAAA  CCTTGCTGCC  AAATTTGCCT  GATAAACTTA  GGTCCATGCC  AAATGGGAAT   1440
            1441 CATATACAAA  GACATGGCTT  ACGAAAGTCT  CCACAAAGTG  ATCAAAGGTT  GCTAAATGCT   1500
            1501 TCTAAAACGT  CAAAAAGTTT  TGTCAAAAGT  AATGGGATAG  AACCTGAGTC  TCGACCACAC   1560
            1561 AGAGAGATGG  CAGTTGATGT  GCCAGATTCT  TTTGTTGGTA  TTGCCAAAAC  TGCTCCCCGA   1620
            1621 TATCCTCCTC  AAAAAATGAA  TGATTCTGGT  GAATCAAAGA  AAGAGCAGCA  TACAGAATTC   1680
            1681 TTTATCAATA  GTTCTGGTGA  TAGCTCTTCC  ACAGAAAACG  ATCCAAAAAT  TATGTCTATG   1740
            1741 TTACCAAAAA  GTAGACTTAG  TAATAAGAGT  AATTTTAGTG  CTAAAGAATA  TATTCCTAAA   1800
            1801 CAAAGTGCTG  ATATAAGTGA  CTTTCAGGAC  AGGACTGTTG  AAAGTTTAGA  AAATGCAACT   1860
            1861 GAAGAACAAC  TAGAAAGGAT  AAGAAGATAT  CAGGAAGATA  TCAGGAAGCG  GAAAATTGCT   1920
            1921 GAAGAAAAGC  AAGCAAAAGA  GAATGAGTTT  CTTCGCAATT  CTCTTCGAGG  TTCTAAAAAG   1980
            1981 TTGCAAGCTC  TTGAAACTAA  TCCTCCTCAG  GCACCAAAAC  ATGGTGTAAT  CAATTCTGCA   2040
            2041 TTTGAATTTG  AAGAGGATGA  TACTGACTTT  TTAACAACTA  GGCAAAAAGA  TGGTAGTCTA   2100
            2101 GTAGGCAGAA  TAGATGATTC  CAAGTTGCAA  ACTCCAGAGC  TTGTTAAAAC  ATTTGGTGCT   2160
            2161 TCTGAGTTGC  TTCAAAGTCT  CTACCGATTA  AGTTCAAGCC  TTCAGGGAAA  TGGCCACAAA   2220
            2221 GATTCTGACC  TTATGTTAGT  GGAGAGTCTA  ATTCGGAATG  CAGATTTCCA  AAGCATACTT   2280
            2281 GCTATCCATA  ACAAAGTGCA  AGAAGTGTGT  TGTTTTAAAT  GTCCGCCAAC  ACCTGTTACA   2340
            2341 AGTGAATCTC  AAGATATTAC  TCAAGAGGTT  ATAAATATGT  TACAAGAAAG  CCAGTCTTCT   2400
            2401 GAGGCTCTTG  AATTAGTAGA  CATCTTGAGT  AAATTTGAGA  TGGAAGGTTT  GTTTTATGCT   2460
            2461 CATGATAAAA  TATCTGAGAG  GCAAGCAGTA  CCAACTATTA  CTCCAGATGA  AGAACTCTTG   2520
            2521 GACAGAGCAT  CCCAGTACAC  AGAAGAAAGT  GTTAAAATTG  TTAGAATAGA  TAAAACAAAT   2580
            2581 GAACCTTTGG  GAGCAACTGT  GAGAAATGAA  GGTGAGGCTG  TTGTTATAGG  GCGAGTAGTG   2640
            2641 AAAGGTGGTG  CTGCAGAAAA  AAGTGGTCTT  CTCCATGAAG  GTGATGAAAT  ATTAGAAGTT   2700
            2701 AATGGTGTAG  AGATGCGTGG  CAAAACTGTA  AATGATGTCT  GTGATGTTTT  AGCTACCATG   2760
            2761 AATGGAACAT  TAACATTTTT  GATTATTCCT  ACTCAGCAAG  AGCATAAGAG  AAGTTCTCAG   2820
            2821 CGTGAAGTAG  TTATGCATTT  AAAAGCACAT  TTTGATTATG  ATCCTGATGA  CGATTTATAC   2880
            2881 TGCCCTTGTC  GAGAGTTAGG  AATATCATTT  CAGAAAGGGG  ACATCCTTCA  TATAATCAAT   2940
            2941 CAAGATGATC  CCAACTGGTG  GCAAGCTTAT  AGAGAAGGGG  AAGAGGACCA  ACCACTGGCT   3000
            3001 GGACTTGTTC  CAAGTAAAAC  ATTTCAAGAA  CAACGAGAAT  CAATGAAACA  GGCAATAATT   3060
            3061 GGAGAAACAT  CTAACAGAGA  AAAAGAGAAG  AAAGTAGGGA  CATTTCTTTG  TGCATATATG   3120
            3121 CAACATAGGA  AGAAAAAGAA  AAAATTATAC  AATGCAAATG  AAGATTTAGA  AGATCAAATT   3180
            3181 TTAACATATG  AAGAAGTGGC  TTTGTATTAT  CCCCGAGCTA  ATCGCAAACG  ACCAACAGTG   3240
            3241 TTGATAGGAC  CTCCAAATAT  AGGACGGCAT  GAACTTAGGC  AAAGGTTAAT  GGAAGATACA   3300
            3301 GAAAGATTTG  CTGCTGCTGT  TCCTCACACC  AGCAGAGCTA  AGAGAGATTC  TGAGGTGGAT   3360
            3361 GGGTCTGACT  ATCATTTCAT  AACCAGAGCA  CAGTTTGAGT  CTGATATAGC  TGCTGGCAAG   3420
            3421 TTTGTTGAAC  ATGGGGAGTA  TGAAAAGAAT  TATTATGGTA  CAAGCTTGGA  TGCAATCAGA   3480
            3481 GCTGTGGTAA  ATTCAGGCAA  AATCTGTGTT  CTCAATCTGC  ATCCTCAGTC  ACTGAAAATT   3540
            3541 TTGAAAAATT  CAGATCTTCA  GCCATATGTT  GTATTTGTTG  CTCCACCATC  TTTAGAAAAA   3600
            3601 CTGCGAATGA  ATCGTATCAA  AGCTGGAGAC  AATCCCAAGG  ATGATGAGCT  TAAAGATATT   3660
            3661 ATAGAGAAAG  CCCGAGAGAT  GGAAGAAAAT  TATGGCCATT  ACTTTGATAT  GGTGATTGTG   3720
            3721 AATTCTGATA  TTGATAAAGC  ATTCAATGAA  CTACTAAAAG  AAATTAACAC  ATTAGAAAGA   3780
            3781 GAGCCACAGT  GGGTGCCTGC  AATATGGCTT  AAAAATAACG  CCAAT     3825
Single Nucleotide Polymorphisms
240G= 0.90T= 0.10  
345G= 0.85A= 0.15  
385T= 0.88G= 0.13  
597G= 0.71C= 0.29  
605T= 0.52C= 0.48  
1266A= 0.62G= 0.38  
1461A= 0.61G= 0.37T= 0.02 
2313T= 0.59C= 0.41  
3219T= 0.58C= 0.42  
3303A= 0.53G= 0.47  
3666G= 0.57A= 0.43