CSH_539_SNPS
            1 ATGGCTGAAG  CAAGAATTGC  TGTAGCTGAA  CCTAGAGTGA  ATACTGTTGA  AGAAATTTCT   60
            61 TCTCCGCAGA  CATGGAAAGA  AGTGTTTTCT  TCATTTCGTA  GTACTGCAAC  TAAACGATAC   120
            121 TACAAAGTTA  GGAATCTTAT  TTATAATGGA  GTATGGCCTG  CAACTCTTTC  TAATGTTAGA   180
            181 CTCACGATCA  GTACATGTAT  TGCTCTCATG  CTTATTGAGC  CAAGTATTAC  TTCACCTATA   240
            241 AATGCATTTT  TATGGAAAAT  AACACATATT  TTATATTTGA  AAGGTTTGCC  AAGAACTCTG   300
            301 CAGGCATTGT  TAGTTTCTGG  ATTGGTTGGA  GTTGTGTCAT  TTATCTTATT  AATGGTTGTA   360
            361 CGGCAAGGAT  TGTTAAGACT  GCTTTTGTCA  TATAGGGGAT  GGATGTATGA  AAATCCTCGA   420
            421 AGTCACACAA  TAGTTACAAA  AATGTGGTGT  GGGGCTGTAA  AGTTATTGAG  TGGGTACAAA   480
            481 CCTTCATTGT  ATAGTTGCCA  AAGATCTCTT  CCTCGTCTTC  CAGTTCCTGC  TGTGCGGGAT   540
            541 ACACTCAATA  GGTTATATGA  ATCATTGAGG  CCTCTCTGTA  CAGATGCTGA  ATTAAAAGAA   600
            601 ATTATGCAAC  AGGGAAAGGA  ATTTGAAAGC  ACGCTATCTC  ACAAGCTGCA  AAATGTATTA   660
            661 CTGTTAAAGT  CATGGTTTTG  TCAAAACTAT  GTGAGTGACT  GGTGGGAGAA  GTATGCATAT   720
            721 CTTAGGAGTC  GCAGTCCTTT  ACCAAATAAT  AGCAATTATT  ATTGTTGTGA  TGAATGTTAT   780
            781 TGGGTGCCCA  CAGATAAGCC  AGTTTCTCGA  GCTGCTTATT  TGATATACAA  CATACTTGTG   840
            841 TGTAAGAGAC  TGATTGATCG  GGAAGAGCTT  GAACCATTAG  TTCTTAGAAG  TACAGTTCCT   900
            901 ATTTGTATGG  CTCAGTATGA  AAGGCTATTT  AGTGCTGTGA  GGATTCCTGG  AGTTGAAGAT   960
            961 GATCATATTT  TACACTGTGA  AGATTCTAAG  CATATTGTTA  TTTCTGTTAA  TGGAGTTTAT   1020
            1021 TACAAGGTAG  ATGTTTGTGA  TTCAAAAAAT  CAGTTGTTAG  CCCCCACAAC  TTTGGAGGAA   1080
            1081 CAGTTGAATT  GGATTGTTGA  AGATGCTAAA  AATCAGCAAG  AATCCTATAC  TGAAGCTGAA   1140
            1141 AAGTCTATTG  CATCATTGAC  TGCTTTAAAA  CGTCCTCAGT  GGGCAGACAT  TCGTAAAACT   1200
            1201 CACCTAAGCT  CTGGAGTGAA  TAGAGATAGT  CGTAGAATTA  TCGAGAAGGC  CATATTTTGT   1260
            1261 GTTACTTTAA  CAGATTATGT  ACCTTCAAAC  CTCACTGAGA  AAGGCAAATA  CTTGTTACAC   1320
            1321 GGAGATGGCA  AGTCTCTTTG  GTTTGATAAA  TCTCTTAATC  TCATTGTATT  TGGAAATGCT   1380
            1381 GCTTCTGGAC  TGAATTGTGA  ACATACTGTT  GCTGATGCAC  CTGCAATGGC  TCATATGTGG   1440
            1441 GAATATGCCA  TGTCTAGAGA  AGTTTTGGAA  AGGCTCTTTG  ATGAAAATGG  CTATTGTATG   1500
            1501 CCATTCAGCC  GAGCTTTCAA  ACAGGCTAAA  GTGAAACAGC  CACAAAGACT  TATCTGGGAA   1560
            1561 ATCACTCCTG  ACCTTGAAGT  TAACATTAAA  GAAGCTGTAA  TATTTTCAAC  TATGAATAAT   1620
            1621 GATGATTTAG  ATTTAGAAGT  GTATGATCAC  AACAAGTGGG  GCAAAGGTGT  TATTAAGAAA   1680
            1681 TGCAAAGTAT  CTCCCGATGC  ATTTGTTCAA  CTTGCTTTGC  AGTTAGCTTA  TTATAAAGAA   1740
            1741 TCCAAAAAAT  TTGTGCAGAC  TTATGAAGCT  TCTATGACAA  GATTATACTT  ATGTGGTAGG   1800
            1801 ACTGAAACTG  TTAGATCTTG  TACTGTGGAA  TCTAAAGATT  TTGTGTTGAG  CATGGTGAAA   1860
            1861 AAAGATGCTG  ATAATACTAT  GAAGCAGAAC  TTATTGATAC  AAGCAGCAGA  GAAACACCAG   1920
            1921 CAACTTTACA  GAGATGCCAT  GAATGGTAAA  GGAATTGATC  GTCACCTGTT  TGCTCTGTAT   1980
            1981 GTTGCTTGCA  AAGGATATGG  CTATGAGAGT  GATTTTCTGC  TCAAAACAAT  AACCCGTCCA   2040
            2041 TGGACACTTT  CTACTAGTCA  GACACCCCAT  ACACAACTAA  CTGCCCTGCC  AGATGCAAAT   2100
            2101 TTGCACATCT  TTGATGATAA  GCTTGGAGCT  GGTGGAGGTT  TTGGTCCTGT  GTCAGATGAA   2160
            2161 GGCTATGGAG  TATCATACCT  CTTTCCATCT  GATAATAGAA  TCTTCTTCCA  TGTGTCGTCT   2220
            2221 AAATTTTCCT  GTCCACATAC  CAGTTCAAAA  CGATTTTTAA  GTCTTTTGGT  AGAAAGCATG   2280
            2281 CAGGAAATGG  TTTCAATATG  TGAAGATCAG         2310
Single Nucleotide Polymorphisms
741A= 0.77G= 0.23  
1962T= 0.85C= 0.15  
2067C= 0.89T= 0.11